Protein–RNA interactions for Protein: Q15651

HMGN3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3Q15651 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
HMGN3Q15651 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
HMGN3Q15651 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
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HMGN3Q15651 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
HMGN3Q15651 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
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HMGN3Q15651 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
HMGN3Q15651 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
HMGN3Q15651 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
HMGN3Q15651 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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HMGN3Q15651 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
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HMGN3Q15651 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
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HMGN3Q15651 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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HMGN3Q15651 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
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HMGN3Q15651 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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HMGN3Q15651 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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HMGN3Q15651 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
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HMGN3Q15651 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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HMGN3Q15651 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HMGN3Q15651 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HMGN3Q15651 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HMGN3Q15651 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HMGN3Q15651 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HMGN3Q15651 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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HMGN3Q15651 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HMGN3Q15651 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HMGN3Q15651 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HMGN3Q15651 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HMGN3Q15651 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HMGN3Q15651 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HMGN3Q15651 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HMGN3Q15651 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HMGN3Q15651 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HMGN3Q15651 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
HMGN3Q15651 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HMGN3Q15651 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HMGN3Q15651 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HMGN3Q15651 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HMGN3Q15651 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HMGN3Q15651 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HMGN3Q15651 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HMGN3Q15651 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HMGN3Q15651 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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