Protein–RNA interactions for Protein: Q15637

SF1, Splicing factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF1Q15637 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SF1Q15637 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SF1Q15637 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SF1Q15637 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SF1Q15637 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SF1Q15637 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SF1Q15637 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SF1Q15637 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SF1Q15637 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SF1Q15637 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SF1Q15637 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SF1Q15637 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SF1Q15637 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SF1Q15637 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SF1Q15637 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SF1Q15637 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SF1Q15637 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SF1Q15637 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SF1Q15637 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SF1Q15637 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SF1Q15637 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SF1Q15637 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SF1Q15637 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SF1Q15637 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SF1Q15637 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SF1Q15637 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SF1Q15637 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SF1Q15637 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SF1Q15637 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SF1Q15637 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SF1Q15637 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SF1Q15637 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SF1Q15637 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SF1Q15637 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SF1Q15637 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SF1Q15637 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SF1Q15637 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SF1Q15637 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SF1Q15637 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SF1Q15637 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SF1Q15637 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SF1Q15637 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SF1Q15637 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SF1Q15637 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SF1Q15637 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SF1Q15637 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SF1Q15637 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SF1Q15637 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SF1Q15637 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SF1Q15637 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SF1Q15637 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SF1Q15637 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SF1Q15637 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SF1Q15637 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SF1Q15637 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SF1Q15637 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SF1Q15637 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SF1Q15637 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SF1Q15637 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SF1Q15637 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SF1Q15637 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SF1Q15637 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SF1Q15637 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SF1Q15637 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SF1Q15637 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SF1Q15637 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SF1Q15637 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SF1Q15637 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SF1Q15637 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SF1Q15637 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SF1Q15637 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SF1Q15637 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SF1Q15637 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SF1Q15637 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SF1Q15637 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SF1Q15637 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SF1Q15637 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SF1Q15637 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SF1Q15637 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SF1Q15637 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SF1Q15637 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SF1Q15637 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SF1Q15637 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SF1Q15637 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SF1Q15637 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SF1Q15637 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SF1Q15637 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SF1Q15637 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SF1Q15637 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SF1Q15637 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SF1Q15637 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SF1Q15637 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SF1Q15637 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SF1Q15637 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SF1Q15637 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SF1Q15637 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SF1Q15637 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SF1Q15637 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SF1Q15637 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SF1Q15637 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms