Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

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Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LAPTM4AQ15012 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LAPTM4AQ15012 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LAPTM4AQ15012 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LAPTM4AQ15012 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LAPTM4AQ15012 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LAPTM4AQ15012 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LAPTM4AQ15012 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LAPTM4AQ15012 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LAPTM4AQ15012 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LAPTM4AQ15012 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LAPTM4AQ15012 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LAPTM4AQ15012 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LAPTM4AQ15012 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LAPTM4AQ15012 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LAPTM4AQ15012 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LAPTM4AQ15012 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LAPTM4AQ15012 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
LAPTM4AQ15012 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LAPTM4AQ15012 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LAPTM4AQ15012 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LAPTM4AQ15012 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LAPTM4AQ15012 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LAPTM4AQ15012 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LAPTM4AQ15012 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LAPTM4AQ15012 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LAPTM4AQ15012 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LAPTM4AQ15012 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LAPTM4AQ15012 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LAPTM4AQ15012 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LAPTM4AQ15012 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LAPTM4AQ15012 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LAPTM4AQ15012 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LAPTM4AQ15012 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LAPTM4AQ15012 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LAPTM4AQ15012 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LAPTM4AQ15012 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LAPTM4AQ15012 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LAPTM4AQ15012 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LAPTM4AQ15012 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LAPTM4AQ15012 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LAPTM4AQ15012 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LAPTM4AQ15012 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LAPTM4AQ15012 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LAPTM4AQ15012 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LAPTM4AQ15012 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LAPTM4AQ15012 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LAPTM4AQ15012 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LAPTM4AQ15012 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LAPTM4AQ15012 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LAPTM4AQ15012 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LAPTM4AQ15012 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LAPTM4AQ15012 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LAPTM4AQ15012 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
LAPTM4AQ15012 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LAPTM4AQ15012 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LAPTM4AQ15012 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LAPTM4AQ15012 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LAPTM4AQ15012 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LAPTM4AQ15012 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LAPTM4AQ15012 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LAPTM4AQ15012 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LAPTM4AQ15012 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LAPTM4AQ15012 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LAPTM4AQ15012 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LAPTM4AQ15012 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LAPTM4AQ15012 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LAPTM4AQ15012 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LAPTM4AQ15012 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
LAPTM4AQ15012 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LAPTM4AQ15012 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LAPTM4AQ15012 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LAPTM4AQ15012 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LAPTM4AQ15012 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LAPTM4AQ15012 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LAPTM4AQ15012 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LAPTM4AQ15012 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LAPTM4AQ15012 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LAPTM4AQ15012 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LAPTM4AQ15012 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LAPTM4AQ15012 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
LAPTM4AQ15012 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LAPTM4AQ15012 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LAPTM4AQ15012 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LAPTM4AQ15012 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LAPTM4AQ15012 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LAPTM4AQ15012 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LAPTM4AQ15012 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LAPTM4AQ15012 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LAPTM4AQ15012 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
LAPTM4AQ15012 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LAPTM4AQ15012 HAPLN1-206ENST00000514416 1145 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LAPTM4AQ15012 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LAPTM4AQ15012 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
LAPTM4AQ15012 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LAPTM4AQ15012 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LAPTM4AQ15012 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LAPTM4AQ15012 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LAPTM4AQ15012 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
LAPTM4AQ15012 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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