Protein–RNA interactions for Protein: Q14264

ERV3-1, Endogenous retrovirus group 3 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERV3-1Q14264 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ERV3-1Q14264 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ERV3-1Q14264 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ERV3-1Q14264 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ERV3-1Q14264 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ERV3-1Q14264 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ERV3-1Q14264 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ERV3-1Q14264 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ERV3-1Q14264 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ERV3-1Q14264 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ERV3-1Q14264 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ERV3-1Q14264 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
ERV3-1Q14264 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ERV3-1Q14264 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ERV3-1Q14264 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ERV3-1Q14264 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ERV3-1Q14264 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ERV3-1Q14264 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ERV3-1Q14264 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ERV3-1Q14264 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ERV3-1Q14264 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ERV3-1Q14264 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ERV3-1Q14264 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ERV3-1Q14264 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ERV3-1Q14264 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ERV3-1Q14264 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ERV3-1Q14264 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ERV3-1Q14264 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ERV3-1Q14264 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ERV3-1Q14264 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ERV3-1Q14264 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ERV3-1Q14264 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ERV3-1Q14264 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ERV3-1Q14264 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ERV3-1Q14264 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ERV3-1Q14264 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ERV3-1Q14264 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ERV3-1Q14264 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ERV3-1Q14264 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ERV3-1Q14264 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ERV3-1Q14264 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ERV3-1Q14264 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ERV3-1Q14264 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
ERV3-1Q14264 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ERV3-1Q14264 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ERV3-1Q14264 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ERV3-1Q14264 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ERV3-1Q14264 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ERV3-1Q14264 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ERV3-1Q14264 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ERV3-1Q14264 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ERV3-1Q14264 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ERV3-1Q14264 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ERV3-1Q14264 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ERV3-1Q14264 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ERV3-1Q14264 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ERV3-1Q14264 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ERV3-1Q14264 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ERV3-1Q14264 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ERV3-1Q14264 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
ERV3-1Q14264 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ERV3-1Q14264 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ERV3-1Q14264 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ERV3-1Q14264 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ERV3-1Q14264 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ERV3-1Q14264 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ERV3-1Q14264 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ERV3-1Q14264 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ERV3-1Q14264 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ERV3-1Q14264 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ERV3-1Q14264 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ERV3-1Q14264 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ERV3-1Q14264 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ERV3-1Q14264 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ERV3-1Q14264 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ERV3-1Q14264 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ERV3-1Q14264 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ERV3-1Q14264 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ERV3-1Q14264 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ERV3-1Q14264 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ERV3-1Q14264 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ERV3-1Q14264 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ERV3-1Q14264 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ERV3-1Q14264 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ERV3-1Q14264 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ERV3-1Q14264 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
ERV3-1Q14264 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
ERV3-1Q14264 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ERV3-1Q14264 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ERV3-1Q14264 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ERV3-1Q14264 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ERV3-1Q14264 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ERV3-1Q14264 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ERV3-1Q14264 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
ERV3-1Q14264 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ERV3-1Q14264 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ERV3-1Q14264 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ERV3-1Q14264 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ERV3-1Q14264 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ERV3-1Q14264 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms