Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Length 747 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PKP1Q13835 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PKP1Q13835 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PKP1Q13835 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PKP1Q13835 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PKP1Q13835 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PKP1Q13835 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
PKP1Q13835 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
PKP1Q13835 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PKP1Q13835 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PKP1Q13835 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PKP1Q13835 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PKP1Q13835 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PKP1Q13835 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PKP1Q13835 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PKP1Q13835 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PKP1Q13835 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PKP1Q13835 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PKP1Q13835 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PKP1Q13835 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PKP1Q13835 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PKP1Q13835 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PKP1Q13835 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PKP1Q13835 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PKP1Q13835 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PKP1Q13835 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PKP1Q13835 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PKP1Q13835 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PKP1Q13835 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PKP1Q13835 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PKP1Q13835 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PKP1Q13835 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PKP1Q13835 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PKP1Q13835 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PKP1Q13835 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PKP1Q13835 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PKP1Q13835 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PKP1Q13835 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PKP1Q13835 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
PKP1Q13835 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PKP1Q13835 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PKP1Q13835 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PKP1Q13835 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PKP1Q13835 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PKP1Q13835 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PKP1Q13835 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PKP1Q13835 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PKP1Q13835 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PKP1Q13835 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PKP1Q13835 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
PKP1Q13835 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PKP1Q13835 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
PKP1Q13835 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PKP1Q13835 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PKP1Q13835 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PKP1Q13835 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PKP1Q13835 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PKP1Q13835 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PKP1Q13835 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PKP1Q13835 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PKP1Q13835 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PKP1Q13835 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PKP1Q13835 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PKP1Q13835 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PKP1Q13835 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PKP1Q13835 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
PKP1Q13835 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PKP1Q13835 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PKP1Q13835 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PKP1Q13835 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PKP1Q13835 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PKP1Q13835 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PKP1Q13835 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PKP1Q13835 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PKP1Q13835 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
PKP1Q13835 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PKP1Q13835 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PKP1Q13835 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PKP1Q13835 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PKP1Q13835 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PKP1Q13835 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PKP1Q13835 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PKP1Q13835 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PKP1Q13835 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
PKP1Q13835 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PKP1Q13835 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PKP1Q13835 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PKP1Q13835 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PKP1Q13835 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PKP1Q13835 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PKP1Q13835 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PKP1Q13835 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PKP1Q13835 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
PKP1Q13835 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PKP1Q13835 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PKP1Q13835 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PKP1Q13835 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PKP1Q13835 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PKP1Q13835 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PKP1Q13835 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
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