Protein–RNA interactions for Protein: Q13639

HTR4, 5-hydroxytryptamine receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR4Q13639 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HTR4Q13639 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HTR4Q13639 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HTR4Q13639 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HTR4Q13639 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HTR4Q13639 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HTR4Q13639 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
HTR4Q13639 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HTR4Q13639 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
HTR4Q13639 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HTR4Q13639 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HTR4Q13639 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HTR4Q13639 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HTR4Q13639 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HTR4Q13639 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HTR4Q13639 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HTR4Q13639 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HTR4Q13639 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HTR4Q13639 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HTR4Q13639 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HTR4Q13639 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HTR4Q13639 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HTR4Q13639 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HTR4Q13639 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HTR4Q13639 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HTR4Q13639 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HTR4Q13639 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HTR4Q13639 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HTR4Q13639 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HTR4Q13639 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HTR4Q13639 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HTR4Q13639 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HTR4Q13639 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HTR4Q13639 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HTR4Q13639 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HTR4Q13639 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HTR4Q13639 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HTR4Q13639 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HTR4Q13639 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HTR4Q13639 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HTR4Q13639 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HTR4Q13639 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HTR4Q13639 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HTR4Q13639 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
HTR4Q13639 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HTR4Q13639 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HTR4Q13639 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HTR4Q13639 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
HTR4Q13639 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HTR4Q13639 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HTR4Q13639 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HTR4Q13639 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
HTR4Q13639 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.46
HTR4Q13639 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
HTR4Q13639 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
HTR4Q13639 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HTR4Q13639 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HTR4Q13639 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HTR4Q13639 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
HTR4Q13639 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
HTR4Q13639 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HTR4Q13639 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HTR4Q13639 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HTR4Q13639 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HTR4Q13639 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HTR4Q13639 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HTR4Q13639 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HTR4Q13639 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HTR4Q13639 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HTR4Q13639 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HTR4Q13639 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HTR4Q13639 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HTR4Q13639 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HTR4Q13639 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HTR4Q13639 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HTR4Q13639 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HTR4Q13639 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
HTR4Q13639 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HTR4Q13639 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HTR4Q13639 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HTR4Q13639 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HTR4Q13639 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HTR4Q13639 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
HTR4Q13639 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HTR4Q13639 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HTR4Q13639 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HTR4Q13639 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HTR4Q13639 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
HTR4Q13639 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HTR4Q13639 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HTR4Q13639 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HTR4Q13639 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HTR4Q13639 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HTR4Q13639 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HTR4Q13639 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HTR4Q13639 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HTR4Q13639 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
HTR4Q13639 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HTR4Q13639 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
HTR4Q13639 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
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