Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CUL1Q13616 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CUL1Q13616 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CUL1Q13616 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CUL1Q13616 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CUL1Q13616 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CUL1Q13616 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CUL1Q13616 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CUL1Q13616 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CUL1Q13616 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CUL1Q13616 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CUL1Q13616 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CUL1Q13616 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CUL1Q13616 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CUL1Q13616 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CUL1Q13616 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CUL1Q13616 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CUL1Q13616 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CUL1Q13616 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CUL1Q13616 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CUL1Q13616 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CUL1Q13616 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CUL1Q13616 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CUL1Q13616 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CUL1Q13616 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CUL1Q13616 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CUL1Q13616 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CUL1Q13616 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CUL1Q13616 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CUL1Q13616 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CUL1Q13616 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CUL1Q13616 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CUL1Q13616 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CUL1Q13616 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CUL1Q13616 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CUL1Q13616 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CUL1Q13616 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CUL1Q13616 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CUL1Q13616 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CUL1Q13616 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CUL1Q13616 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CUL1Q13616 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CUL1Q13616 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CUL1Q13616 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CUL1Q13616 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CUL1Q13616 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CUL1Q13616 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CUL1Q13616 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CUL1Q13616 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CUL1Q13616 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CUL1Q13616 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CUL1Q13616 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CUL1Q13616 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CUL1Q13616 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CUL1Q13616 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CUL1Q13616 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CUL1Q13616 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CUL1Q13616 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CUL1Q13616 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CUL1Q13616 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CUL1Q13616 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CUL1Q13616 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CUL1Q13616 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CUL1Q13616 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CUL1Q13616 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CUL1Q13616 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CUL1Q13616 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CUL1Q13616 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CUL1Q13616 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CUL1Q13616 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CUL1Q13616 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CUL1Q13616 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CUL1Q13616 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CUL1Q13616 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CUL1Q13616 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CUL1Q13616 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CUL1Q13616 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CUL1Q13616 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CUL1Q13616 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CUL1Q13616 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CUL1Q13616 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CUL1Q13616 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CUL1Q13616 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CUL1Q13616 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CUL1Q13616 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CUL1Q13616 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CUL1Q13616 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CUL1Q13616 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CUL1Q13616 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CUL1Q13616 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CUL1Q13616 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CUL1Q13616 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CUL1Q13616 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CUL1Q13616 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CUL1Q13616 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CUL1Q13616 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CUL1Q13616 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CUL1Q13616 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CUL1Q13616 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CUL1Q13616 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
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