Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TOP3AQ13472 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TOP3AQ13472 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TOP3AQ13472 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TOP3AQ13472 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TOP3AQ13472 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TOP3AQ13472 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TOP3AQ13472 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TOP3AQ13472 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TOP3AQ13472 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TOP3AQ13472 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TOP3AQ13472 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TOP3AQ13472 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TOP3AQ13472 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TOP3AQ13472 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TOP3AQ13472 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TOP3AQ13472 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TOP3AQ13472 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TOP3AQ13472 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TOP3AQ13472 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TOP3AQ13472 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TOP3AQ13472 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TOP3AQ13472 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TOP3AQ13472 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TOP3AQ13472 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TOP3AQ13472 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TOP3AQ13472 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TOP3AQ13472 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TOP3AQ13472 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TOP3AQ13472 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TOP3AQ13472 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TOP3AQ13472 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TOP3AQ13472 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TOP3AQ13472 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TOP3AQ13472 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TOP3AQ13472 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TOP3AQ13472 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TOP3AQ13472 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TOP3AQ13472 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TOP3AQ13472 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TOP3AQ13472 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TOP3AQ13472 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TOP3AQ13472 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TOP3AQ13472 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TOP3AQ13472 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TOP3AQ13472 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TOP3AQ13472 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TOP3AQ13472 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TOP3AQ13472 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TOP3AQ13472 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TOP3AQ13472 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TOP3AQ13472 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TOP3AQ13472 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TOP3AQ13472 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TOP3AQ13472 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TOP3AQ13472 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TOP3AQ13472 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TOP3AQ13472 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TOP3AQ13472 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TOP3AQ13472 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TOP3AQ13472 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TOP3AQ13472 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TOP3AQ13472 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TOP3AQ13472 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TOP3AQ13472 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TOP3AQ13472 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TOP3AQ13472 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TOP3AQ13472 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TOP3AQ13472 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TOP3AQ13472 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TOP3AQ13472 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TOP3AQ13472 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TOP3AQ13472 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TOP3AQ13472 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TOP3AQ13472 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TOP3AQ13472 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TOP3AQ13472 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TOP3AQ13472 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TOP3AQ13472 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TOP3AQ13472 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TOP3AQ13472 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TOP3AQ13472 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TOP3AQ13472 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TOP3AQ13472 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TOP3AQ13472 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TOP3AQ13472 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TOP3AQ13472 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TOP3AQ13472 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TOP3AQ13472 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TOP3AQ13472 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TOP3AQ13472 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TOP3AQ13472 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TOP3AQ13472 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TOP3AQ13472 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TOP3AQ13472 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TOP3AQ13472 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TOP3AQ13472 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TOP3AQ13472 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TOP3AQ13472 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TOP3AQ13472 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
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