Protein–RNA interactions for Protein: Q13315

ATM, Serine-protein kinase ATM, humanhuman

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Length 3,056 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMQ13315 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATMQ13315 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATMQ13315 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATMQ13315 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATMQ13315 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATMQ13315 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATMQ13315 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATMQ13315 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATMQ13315 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ATMQ13315 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ATMQ13315 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATMQ13315 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATMQ13315 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATMQ13315 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATMQ13315 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATMQ13315 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATMQ13315 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATMQ13315 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATMQ13315 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ATMQ13315 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATMQ13315 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATMQ13315 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ATMQ13315 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATMQ13315 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATMQ13315 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATMQ13315 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATMQ13315 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATMQ13315 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATMQ13315 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATMQ13315 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATMQ13315 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATMQ13315 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATMQ13315 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATMQ13315 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ATMQ13315 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ATMQ13315 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ATMQ13315 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATMQ13315 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATMQ13315 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATMQ13315 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATMQ13315 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATMQ13315 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ATMQ13315 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATMQ13315 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATMQ13315 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATMQ13315 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATMQ13315 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATMQ13315 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATMQ13315 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATMQ13315 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATMQ13315 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATMQ13315 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATMQ13315 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATMQ13315 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATMQ13315 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATMQ13315 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ATMQ13315 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ATMQ13315 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATMQ13315 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATMQ13315 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATMQ13315 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATMQ13315 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATMQ13315 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATMQ13315 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATMQ13315 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATMQ13315 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATMQ13315 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATMQ13315 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATMQ13315 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATMQ13315 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATMQ13315 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATMQ13315 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATMQ13315 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATMQ13315 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ATMQ13315 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATMQ13315 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ATMQ13315 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATMQ13315 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ATMQ13315 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATMQ13315 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATMQ13315 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATMQ13315 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATMQ13315 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATMQ13315 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATMQ13315 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATMQ13315 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATMQ13315 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATMQ13315 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ATMQ13315 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ATMQ13315 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATMQ13315 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATMQ13315 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ATMQ13315 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATMQ13315 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATMQ13315 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATMQ13315 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATMQ13315 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATMQ13315 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATMQ13315 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATMQ13315 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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