Protein–RNA interactions for Protein: Q13296

SCGB2A2, Mammaglobin-A, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCGB2A2Q13296 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SCGB2A2Q13296 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SCGB2A2Q13296 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SCGB2A2Q13296 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SCGB2A2Q13296 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SCGB2A2Q13296 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SCGB2A2Q13296 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SCGB2A2Q13296 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SCGB2A2Q13296 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SCGB2A2Q13296 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SCGB2A2Q13296 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SCGB2A2Q13296 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SCGB2A2Q13296 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SCGB2A2Q13296 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SCGB2A2Q13296 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SCGB2A2Q13296 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SCGB2A2Q13296 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SCGB2A2Q13296 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SCGB2A2Q13296 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SCGB2A2Q13296 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SCGB2A2Q13296 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SCGB2A2Q13296 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SCGB2A2Q13296 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SCGB2A2Q13296 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SCGB2A2Q13296 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SCGB2A2Q13296 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SCGB2A2Q13296 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SCGB2A2Q13296 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SCGB2A2Q13296 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SCGB2A2Q13296 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SCGB2A2Q13296 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SCGB2A2Q13296 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SCGB2A2Q13296 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SCGB2A2Q13296 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SCGB2A2Q13296 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SCGB2A2Q13296 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SCGB2A2Q13296 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SCGB2A2Q13296 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
SCGB2A2Q13296 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
SCGB2A2Q13296 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SCGB2A2Q13296 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
SCGB2A2Q13296 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SCGB2A2Q13296 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SCGB2A2Q13296 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
SCGB2A2Q13296 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SCGB2A2Q13296 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SCGB2A2Q13296 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SCGB2A2Q13296 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SCGB2A2Q13296 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SCGB2A2Q13296 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SCGB2A2Q13296 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SCGB2A2Q13296 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SCGB2A2Q13296 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
SCGB2A2Q13296 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SCGB2A2Q13296 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SCGB2A2Q13296 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SCGB2A2Q13296 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SCGB2A2Q13296 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SCGB2A2Q13296 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SCGB2A2Q13296 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SCGB2A2Q13296 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SCGB2A2Q13296 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SCGB2A2Q13296 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SCGB2A2Q13296 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SCGB2A2Q13296 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SCGB2A2Q13296 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SCGB2A2Q13296 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SCGB2A2Q13296 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SCGB2A2Q13296 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SCGB2A2Q13296 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SCGB2A2Q13296 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SCGB2A2Q13296 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SCGB2A2Q13296 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SCGB2A2Q13296 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SCGB2A2Q13296 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SCGB2A2Q13296 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SCGB2A2Q13296 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
SCGB2A2Q13296 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SCGB2A2Q13296 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
SCGB2A2Q13296 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
SCGB2A2Q13296 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
SCGB2A2Q13296 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SCGB2A2Q13296 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SCGB2A2Q13296 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SCGB2A2Q13296 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SCGB2A2Q13296 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
SCGB2A2Q13296 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
SCGB2A2Q13296 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SCGB2A2Q13296 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SCGB2A2Q13296 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SCGB2A2Q13296 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SCGB2A2Q13296 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SCGB2A2Q13296 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SCGB2A2Q13296 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SCGB2A2Q13296 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SCGB2A2Q13296 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SCGB2A2Q13296 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SCGB2A2Q13296 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
SCGB2A2Q13296 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SCGB2A2Q13296 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms