Protein–RNA interactions for Protein: Q13224

GRIN2B, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, humanhuman

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Length 1,484 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2BQ13224 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
GRIN2BQ13224 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
GRIN2BQ13224 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
GRIN2BQ13224 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
GRIN2BQ13224 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
GRIN2BQ13224 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
GRIN2BQ13224 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
GRIN2BQ13224 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
GRIN2BQ13224 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
GRIN2BQ13224 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
GRIN2BQ13224 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
GRIN2BQ13224 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
GRIN2BQ13224 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
GRIN2BQ13224 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
GRIN2BQ13224 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
GRIN2BQ13224 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
GRIN2BQ13224 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
GRIN2BQ13224 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
GRIN2BQ13224 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
GRIN2BQ13224 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
GRIN2BQ13224 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
GRIN2BQ13224 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
GRIN2BQ13224 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
GRIN2BQ13224 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
GRIN2BQ13224 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
GRIN2BQ13224 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
GRIN2BQ13224 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
GRIN2BQ13224 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
GRIN2BQ13224 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
GRIN2BQ13224 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
GRIN2BQ13224 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
GRIN2BQ13224 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
GRIN2BQ13224 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
GRIN2BQ13224 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
GRIN2BQ13224 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
GRIN2BQ13224 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
GRIN2BQ13224 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
GRIN2BQ13224 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC28.57■■■□□ 2.16
GRIN2BQ13224 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
GRIN2BQ13224 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
GRIN2BQ13224 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
GRIN2BQ13224 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
GRIN2BQ13224 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
GRIN2BQ13224 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
GRIN2BQ13224 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
GRIN2BQ13224 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
GRIN2BQ13224 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
GRIN2BQ13224 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
GRIN2BQ13224 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
GRIN2BQ13224 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
GRIN2BQ13224 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
GRIN2BQ13224 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
GRIN2BQ13224 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
GRIN2BQ13224 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
GRIN2BQ13224 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
GRIN2BQ13224 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
GRIN2BQ13224 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
GRIN2BQ13224 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
GRIN2BQ13224 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
GRIN2BQ13224 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
GRIN2BQ13224 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
GRIN2BQ13224 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
GRIN2BQ13224 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
GRIN2BQ13224 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
GRIN2BQ13224 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
GRIN2BQ13224 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
GRIN2BQ13224 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
GRIN2BQ13224 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
GRIN2BQ13224 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
GRIN2BQ13224 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
GRIN2BQ13224 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
GRIN2BQ13224 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
GRIN2BQ13224 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
GRIN2BQ13224 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC28.55■■■□□ 2.16
GRIN2BQ13224 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
GRIN2BQ13224 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC28.55■■■□□ 2.16
GRIN2BQ13224 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
GRIN2BQ13224 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
GRIN2BQ13224 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
GRIN2BQ13224 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
GRIN2BQ13224 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
GRIN2BQ13224 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
GRIN2BQ13224 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
GRIN2BQ13224 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
GRIN2BQ13224 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
GRIN2BQ13224 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
GRIN2BQ13224 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
GRIN2BQ13224 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
GRIN2BQ13224 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
GRIN2BQ13224 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC28.54■■■□□ 2.16
GRIN2BQ13224 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
GRIN2BQ13224 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
GRIN2BQ13224 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC28.54■■■□□ 2.16
GRIN2BQ13224 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
GRIN2BQ13224 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
GRIN2BQ13224 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
GRIN2BQ13224 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
GRIN2BQ13224 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
GRIN2BQ13224 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
GRIN2BQ13224 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
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