Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DUSP4Q13115 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DUSP4Q13115 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DUSP4Q13115 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DUSP4Q13115 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DUSP4Q13115 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DUSP4Q13115 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DUSP4Q13115 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DUSP4Q13115 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
DUSP4Q13115 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
DUSP4Q13115 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DUSP4Q13115 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
DUSP4Q13115 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DUSP4Q13115 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DUSP4Q13115 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DUSP4Q13115 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DUSP4Q13115 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DUSP4Q13115 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DUSP4Q13115 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DUSP4Q13115 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DUSP4Q13115 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DUSP4Q13115 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DUSP4Q13115 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DUSP4Q13115 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DUSP4Q13115 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DUSP4Q13115 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DUSP4Q13115 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
DUSP4Q13115 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
DUSP4Q13115 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DUSP4Q13115 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DUSP4Q13115 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DUSP4Q13115 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DUSP4Q13115 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DUSP4Q13115 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DUSP4Q13115 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DUSP4Q13115 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
DUSP4Q13115 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DUSP4Q13115 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DUSP4Q13115 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DUSP4Q13115 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DUSP4Q13115 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DUSP4Q13115 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DUSP4Q13115 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DUSP4Q13115 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DUSP4Q13115 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DUSP4Q13115 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DUSP4Q13115 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DUSP4Q13115 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DUSP4Q13115 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DUSP4Q13115 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DUSP4Q13115 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DUSP4Q13115 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DUSP4Q13115 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DUSP4Q13115 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
DUSP4Q13115 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DUSP4Q13115 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DUSP4Q13115 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DUSP4Q13115 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DUSP4Q13115 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DUSP4Q13115 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DUSP4Q13115 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DUSP4Q13115 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DUSP4Q13115 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DUSP4Q13115 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DUSP4Q13115 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DUSP4Q13115 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
DUSP4Q13115 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DUSP4Q13115 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DUSP4Q13115 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DUSP4Q13115 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DUSP4Q13115 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DUSP4Q13115 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DUSP4Q13115 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DUSP4Q13115 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DUSP4Q13115 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DUSP4Q13115 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DUSP4Q13115 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DUSP4Q13115 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DUSP4Q13115 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DUSP4Q13115 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DUSP4Q13115 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DUSP4Q13115 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DUSP4Q13115 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DUSP4Q13115 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DUSP4Q13115 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DUSP4Q13115 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DUSP4Q13115 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DUSP4Q13115 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DUSP4Q13115 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DUSP4Q13115 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DUSP4Q13115 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DUSP4Q13115 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
DUSP4Q13115 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DUSP4Q13115 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DUSP4Q13115 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DUSP4Q13115 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DUSP4Q13115 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DUSP4Q13115 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DUSP4Q13115 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DUSP4Q13115 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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