Protein–RNA interactions for Protein: Q12800

TFCP2, Alpha-globin transcription factor CP2, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFCP2Q12800 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TFCP2Q12800 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TFCP2Q12800 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TFCP2Q12800 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TFCP2Q12800 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TFCP2Q12800 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
TFCP2Q12800 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TFCP2Q12800 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TFCP2Q12800 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TFCP2Q12800 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TFCP2Q12800 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TFCP2Q12800 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TFCP2Q12800 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
TFCP2Q12800 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TFCP2Q12800 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
TFCP2Q12800 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TFCP2Q12800 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
TFCP2Q12800 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
TFCP2Q12800 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TFCP2Q12800 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TFCP2Q12800 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
TFCP2Q12800 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TFCP2Q12800 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TFCP2Q12800 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TFCP2Q12800 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
TFCP2Q12800 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TFCP2Q12800 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TFCP2Q12800 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TFCP2Q12800 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TFCP2Q12800 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TFCP2Q12800 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TFCP2Q12800 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TFCP2Q12800 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TFCP2Q12800 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TFCP2Q12800 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TFCP2Q12800 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TFCP2Q12800 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TFCP2Q12800 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TFCP2Q12800 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TFCP2Q12800 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TFCP2Q12800 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TFCP2Q12800 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
TFCP2Q12800 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
TFCP2Q12800 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
TFCP2Q12800 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
TFCP2Q12800 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TFCP2Q12800 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TFCP2Q12800 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TFCP2Q12800 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TFCP2Q12800 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TFCP2Q12800 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TFCP2Q12800 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TFCP2Q12800 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TFCP2Q12800 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TFCP2Q12800 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TFCP2Q12800 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TFCP2Q12800 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TFCP2Q12800 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TFCP2Q12800 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TFCP2Q12800 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TFCP2Q12800 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TFCP2Q12800 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TFCP2Q12800 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TFCP2Q12800 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TFCP2Q12800 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TFCP2Q12800 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TFCP2Q12800 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TFCP2Q12800 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TFCP2Q12800 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TFCP2Q12800 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TFCP2Q12800 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TFCP2Q12800 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TFCP2Q12800 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TFCP2Q12800 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TFCP2Q12800 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TFCP2Q12800 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TFCP2Q12800 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TFCP2Q12800 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TFCP2Q12800 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TFCP2Q12800 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TFCP2Q12800 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TFCP2Q12800 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TFCP2Q12800 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TFCP2Q12800 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TFCP2Q12800 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TFCP2Q12800 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
TFCP2Q12800 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
TFCP2Q12800 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TFCP2Q12800 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
TFCP2Q12800 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TFCP2Q12800 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TFCP2Q12800 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TFCP2Q12800 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TFCP2Q12800 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
TFCP2Q12800 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
TFCP2Q12800 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
TFCP2Q12800 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TFCP2Q12800 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TFCP2Q12800 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TFCP2Q12800 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms