Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K3

RIPPLY1, Protein ripply1, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY1Q0D2K3 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RIPPLY1Q0D2K3 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RIPPLY1Q0D2K3 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RIPPLY1Q0D2K3 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RIPPLY1Q0D2K3 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RIPPLY1Q0D2K3 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RIPPLY1Q0D2K3 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RIPPLY1Q0D2K3 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RIPPLY1Q0D2K3 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RIPPLY1Q0D2K3 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RIPPLY1Q0D2K3 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RIPPLY1Q0D2K3 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RIPPLY1Q0D2K3 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RIPPLY1Q0D2K3 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RIPPLY1Q0D2K3 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RIPPLY1Q0D2K3 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RIPPLY1Q0D2K3 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RIPPLY1Q0D2K3 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RIPPLY1Q0D2K3 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RIPPLY1Q0D2K3 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RIPPLY1Q0D2K3 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RIPPLY1Q0D2K3 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RIPPLY1Q0D2K3 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RIPPLY1Q0D2K3 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RIPPLY1Q0D2K3 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RIPPLY1Q0D2K3 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RIPPLY1Q0D2K3 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RIPPLY1Q0D2K3 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RIPPLY1Q0D2K3 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RIPPLY1Q0D2K3 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RIPPLY1Q0D2K3 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RIPPLY1Q0D2K3 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RIPPLY1Q0D2K3 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RIPPLY1Q0D2K3 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RIPPLY1Q0D2K3 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RIPPLY1Q0D2K3 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RIPPLY1Q0D2K3 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RIPPLY1Q0D2K3 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RIPPLY1Q0D2K3 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RIPPLY1Q0D2K3 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RIPPLY1Q0D2K3 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RIPPLY1Q0D2K3 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RIPPLY1Q0D2K3 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RIPPLY1Q0D2K3 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RIPPLY1Q0D2K3 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RIPPLY1Q0D2K3 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RIPPLY1Q0D2K3 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RIPPLY1Q0D2K3 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RIPPLY1Q0D2K3 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RIPPLY1Q0D2K3 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RIPPLY1Q0D2K3 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RIPPLY1Q0D2K3 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RIPPLY1Q0D2K3 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RIPPLY1Q0D2K3 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RIPPLY1Q0D2K3 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RIPPLY1Q0D2K3 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RIPPLY1Q0D2K3 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RIPPLY1Q0D2K3 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RIPPLY1Q0D2K3 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RIPPLY1Q0D2K3 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RIPPLY1Q0D2K3 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RIPPLY1Q0D2K3 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RIPPLY1Q0D2K3 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RIPPLY1Q0D2K3 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RIPPLY1Q0D2K3 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RIPPLY1Q0D2K3 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RIPPLY1Q0D2K3 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RIPPLY1Q0D2K3 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RIPPLY1Q0D2K3 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RIPPLY1Q0D2K3 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RIPPLY1Q0D2K3 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RIPPLY1Q0D2K3 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RIPPLY1Q0D2K3 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RIPPLY1Q0D2K3 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RIPPLY1Q0D2K3 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RIPPLY1Q0D2K3 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RIPPLY1Q0D2K3 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RIPPLY1Q0D2K3 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RIPPLY1Q0D2K3 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RIPPLY1Q0D2K3 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RIPPLY1Q0D2K3 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RIPPLY1Q0D2K3 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RIPPLY1Q0D2K3 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RIPPLY1Q0D2K3 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RIPPLY1Q0D2K3 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RIPPLY1Q0D2K3 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RIPPLY1Q0D2K3 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RIPPLY1Q0D2K3 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RIPPLY1Q0D2K3 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RIPPLY1Q0D2K3 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RIPPLY1Q0D2K3 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RIPPLY1Q0D2K3 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RIPPLY1Q0D2K3 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RIPPLY1Q0D2K3 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RIPPLY1Q0D2K3 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RIPPLY1Q0D2K3 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RIPPLY1Q0D2K3 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RIPPLY1Q0D2K3 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RIPPLY1Q0D2K3 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.4 ms