Protein–RNA interactions for Protein: Q08345

DDR1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR1Q08345 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DDR1Q08345 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
DDR1Q08345 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DDR1Q08345 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
DDR1Q08345 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DDR1Q08345 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DDR1Q08345 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
DDR1Q08345 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DDR1Q08345 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DDR1Q08345 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DDR1Q08345 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DDR1Q08345 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DDR1Q08345 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
DDR1Q08345 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DDR1Q08345 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DDR1Q08345 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DDR1Q08345 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DDR1Q08345 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DDR1Q08345 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
DDR1Q08345 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DDR1Q08345 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DDR1Q08345 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
DDR1Q08345 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DDR1Q08345 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
DDR1Q08345 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
DDR1Q08345 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
DDR1Q08345 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
DDR1Q08345 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
DDR1Q08345 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
DDR1Q08345 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
DDR1Q08345 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DDR1Q08345 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
DDR1Q08345 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DDR1Q08345 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DDR1Q08345 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
DDR1Q08345 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
DDR1Q08345 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
DDR1Q08345 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
DDR1Q08345 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
DDR1Q08345 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DDR1Q08345 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DDR1Q08345 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DDR1Q08345 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DDR1Q08345 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
DDR1Q08345 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DDR1Q08345 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
DDR1Q08345 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
DDR1Q08345 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.07
DDR1Q08345 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
DDR1Q08345 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
DDR1Q08345 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
DDR1Q08345 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DDR1Q08345 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DDR1Q08345 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DDR1Q08345 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DDR1Q08345 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DDR1Q08345 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DDR1Q08345 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DDR1Q08345 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DDR1Q08345 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DDR1Q08345 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DDR1Q08345 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DDR1Q08345 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
DDR1Q08345 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DDR1Q08345 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
DDR1Q08345 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DDR1Q08345 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
DDR1Q08345 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DDR1Q08345 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DDR1Q08345 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DDR1Q08345 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DDR1Q08345 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
DDR1Q08345 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DDR1Q08345 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
DDR1Q08345 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DDR1Q08345 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DDR1Q08345 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DDR1Q08345 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DDR1Q08345 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
DDR1Q08345 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
DDR1Q08345 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DDR1Q08345 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DDR1Q08345 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DDR1Q08345 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DDR1Q08345 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
DDR1Q08345 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DDR1Q08345 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DDR1Q08345 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DDR1Q08345 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DDR1Q08345 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DDR1Q08345 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DDR1Q08345 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DDR1Q08345 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DDR1Q08345 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DDR1Q08345 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DDR1Q08345 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DDR1Q08345 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DDR1Q08345 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
DDR1Q08345 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
DDR1Q08345 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms