Protein–RNA interactions for Protein: Q06141

REG3A, Regenerating islet-derived protein 3-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REG3AQ06141 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
REG3AQ06141 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
REG3AQ06141 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
REG3AQ06141 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
REG3AQ06141 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
REG3AQ06141 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
REG3AQ06141 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
REG3AQ06141 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
REG3AQ06141 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
REG3AQ06141 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
REG3AQ06141 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
REG3AQ06141 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
REG3AQ06141 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
REG3AQ06141 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
REG3AQ06141 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
REG3AQ06141 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
REG3AQ06141 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
REG3AQ06141 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
REG3AQ06141 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC12.12□□□□□ -0.47
REG3AQ06141 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
REG3AQ06141 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
REG3AQ06141 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
REG3AQ06141 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
REG3AQ06141 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
REG3AQ06141 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
REG3AQ06141 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
REG3AQ06141 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
REG3AQ06141 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
REG3AQ06141 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
REG3AQ06141 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
REG3AQ06141 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
REG3AQ06141 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
REG3AQ06141 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
REG3AQ06141 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
REG3AQ06141 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
REG3AQ06141 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
REG3AQ06141 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
REG3AQ06141 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
REG3AQ06141 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
REG3AQ06141 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
REG3AQ06141 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
REG3AQ06141 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
REG3AQ06141 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
REG3AQ06141 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
REG3AQ06141 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
REG3AQ06141 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
REG3AQ06141 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
REG3AQ06141 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
REG3AQ06141 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
REG3AQ06141 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
REG3AQ06141 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
REG3AQ06141 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
REG3AQ06141 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
REG3AQ06141 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
REG3AQ06141 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
REG3AQ06141 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
REG3AQ06141 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
REG3AQ06141 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
REG3AQ06141 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
REG3AQ06141 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
REG3AQ06141 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
REG3AQ06141 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
REG3AQ06141 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
REG3AQ06141 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
REG3AQ06141 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
REG3AQ06141 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
REG3AQ06141 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
REG3AQ06141 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
REG3AQ06141 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
REG3AQ06141 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
REG3AQ06141 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC12.11□□□□□ -0.47
REG3AQ06141 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
REG3AQ06141 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
REG3AQ06141 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
REG3AQ06141 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
REG3AQ06141 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.11□□□□□ -0.47
REG3AQ06141 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
REG3AQ06141 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
REG3AQ06141 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
REG3AQ06141 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
REG3AQ06141 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
REG3AQ06141 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
REG3AQ06141 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
REG3AQ06141 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
REG3AQ06141 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
REG3AQ06141 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
REG3AQ06141 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
REG3AQ06141 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
REG3AQ06141 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
REG3AQ06141 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
REG3AQ06141 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
REG3AQ06141 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
REG3AQ06141 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
REG3AQ06141 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
REG3AQ06141 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
REG3AQ06141 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
REG3AQ06141 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
REG3AQ06141 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
REG3AQ06141 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
REG3AQ06141 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms