Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
CALD1Q05682 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
CALD1Q05682 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CALD1Q05682 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CALD1Q05682 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CALD1Q05682 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CALD1Q05682 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CALD1Q05682 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CALD1Q05682 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CALD1Q05682 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CALD1Q05682 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CALD1Q05682 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CALD1Q05682 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CALD1Q05682 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CALD1Q05682 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CALD1Q05682 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CALD1Q05682 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CALD1Q05682 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CALD1Q05682 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CALD1Q05682 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CALD1Q05682 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CALD1Q05682 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CALD1Q05682 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CALD1Q05682 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CALD1Q05682 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CALD1Q05682 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CALD1Q05682 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CALD1Q05682 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CALD1Q05682 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CALD1Q05682 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CALD1Q05682 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CALD1Q05682 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CALD1Q05682 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CALD1Q05682 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CALD1Q05682 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CALD1Q05682 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CALD1Q05682 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CALD1Q05682 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CALD1Q05682 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CALD1Q05682 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CALD1Q05682 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CALD1Q05682 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CALD1Q05682 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CALD1Q05682 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CALD1Q05682 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CALD1Q05682 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CALD1Q05682 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CALD1Q05682 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CALD1Q05682 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CALD1Q05682 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CALD1Q05682 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CALD1Q05682 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CALD1Q05682 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CALD1Q05682 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CALD1Q05682 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CALD1Q05682 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CALD1Q05682 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CALD1Q05682 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CALD1Q05682 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CALD1Q05682 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CALD1Q05682 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CALD1Q05682 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CALD1Q05682 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CALD1Q05682 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CALD1Q05682 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CALD1Q05682 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CALD1Q05682 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CALD1Q05682 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CALD1Q05682 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CALD1Q05682 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CALD1Q05682 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CALD1Q05682 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CALD1Q05682 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CALD1Q05682 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CALD1Q05682 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CALD1Q05682 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CALD1Q05682 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CALD1Q05682 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CALD1Q05682 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CALD1Q05682 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CALD1Q05682 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CALD1Q05682 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CALD1Q05682 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CALD1Q05682 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CALD1Q05682 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CALD1Q05682 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CALD1Q05682 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CALD1Q05682 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CALD1Q05682 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CALD1Q05682 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CALD1Q05682 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CALD1Q05682 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CALD1Q05682 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CALD1Q05682 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CALD1Q05682 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CALD1Q05682 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CALD1Q05682 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CALD1Q05682 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CALD1Q05682 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CALD1Q05682 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms