Protein–RNA interactions for Protein: Q04323

UBXN1, UBX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN1Q04323 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
UBXN1Q04323 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
UBXN1Q04323 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
UBXN1Q04323 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
UBXN1Q04323 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
UBXN1Q04323 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
UBXN1Q04323 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
UBXN1Q04323 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
UBXN1Q04323 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
UBXN1Q04323 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
UBXN1Q04323 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
UBXN1Q04323 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
UBXN1Q04323 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
UBXN1Q04323 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
UBXN1Q04323 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
UBXN1Q04323 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
UBXN1Q04323 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
UBXN1Q04323 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
UBXN1Q04323 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
UBXN1Q04323 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
UBXN1Q04323 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
UBXN1Q04323 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
UBXN1Q04323 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
UBXN1Q04323 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
UBXN1Q04323 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
UBXN1Q04323 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
UBXN1Q04323 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
UBXN1Q04323 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
UBXN1Q04323 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
UBXN1Q04323 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
UBXN1Q04323 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
UBXN1Q04323 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
UBXN1Q04323 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
UBXN1Q04323 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
UBXN1Q04323 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
UBXN1Q04323 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
UBXN1Q04323 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
UBXN1Q04323 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
UBXN1Q04323 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
UBXN1Q04323 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
UBXN1Q04323 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
UBXN1Q04323 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
UBXN1Q04323 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
UBXN1Q04323 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
UBXN1Q04323 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
UBXN1Q04323 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
UBXN1Q04323 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
UBXN1Q04323 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
UBXN1Q04323 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
UBXN1Q04323 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
UBXN1Q04323 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
UBXN1Q04323 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
UBXN1Q04323 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
UBXN1Q04323 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
UBXN1Q04323 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
UBXN1Q04323 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
UBXN1Q04323 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
UBXN1Q04323 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
UBXN1Q04323 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
UBXN1Q04323 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
UBXN1Q04323 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
UBXN1Q04323 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
UBXN1Q04323 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
UBXN1Q04323 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
UBXN1Q04323 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
UBXN1Q04323 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
UBXN1Q04323 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
UBXN1Q04323 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
UBXN1Q04323 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
UBXN1Q04323 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
UBXN1Q04323 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
UBXN1Q04323 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
UBXN1Q04323 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
UBXN1Q04323 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
UBXN1Q04323 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
UBXN1Q04323 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
UBXN1Q04323 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
UBXN1Q04323 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
UBXN1Q04323 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
UBXN1Q04323 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
UBXN1Q04323 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
UBXN1Q04323 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
UBXN1Q04323 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
UBXN1Q04323 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
UBXN1Q04323 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
UBXN1Q04323 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
UBXN1Q04323 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
UBXN1Q04323 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
UBXN1Q04323 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
UBXN1Q04323 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
UBXN1Q04323 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
UBXN1Q04323 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
UBXN1Q04323 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
UBXN1Q04323 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
UBXN1Q04323 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
UBXN1Q04323 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
UBXN1Q04323 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
UBXN1Q04323 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
UBXN1Q04323 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
UBXN1Q04323 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms