Protein–RNA interactions for Protein: Q00987

MDM2, E3 ubiquitin-protein ligase Mdm2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM2Q00987 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MDM2Q00987 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
MDM2Q00987 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MDM2Q00987 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
MDM2Q00987 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MDM2Q00987 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MDM2Q00987 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MDM2Q00987 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MDM2Q00987 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MDM2Q00987 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
MDM2Q00987 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MDM2Q00987 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MDM2Q00987 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
MDM2Q00987 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MDM2Q00987 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MDM2Q00987 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MDM2Q00987 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MDM2Q00987 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MDM2Q00987 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MDM2Q00987 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MDM2Q00987 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MDM2Q00987 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MDM2Q00987 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MDM2Q00987 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MDM2Q00987 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MDM2Q00987 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MDM2Q00987 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MDM2Q00987 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MDM2Q00987 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
MDM2Q00987 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MDM2Q00987 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MDM2Q00987 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MDM2Q00987 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
MDM2Q00987 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
MDM2Q00987 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MDM2Q00987 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MDM2Q00987 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MDM2Q00987 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MDM2Q00987 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MDM2Q00987 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
MDM2Q00987 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MDM2Q00987 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MDM2Q00987 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MDM2Q00987 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MDM2Q00987 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
MDM2Q00987 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MDM2Q00987 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MDM2Q00987 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MDM2Q00987 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MDM2Q00987 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MDM2Q00987 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MDM2Q00987 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MDM2Q00987 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MDM2Q00987 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MDM2Q00987 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MDM2Q00987 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MDM2Q00987 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MDM2Q00987 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MDM2Q00987 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
MDM2Q00987 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MDM2Q00987 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MDM2Q00987 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MDM2Q00987 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MDM2Q00987 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MDM2Q00987 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MDM2Q00987 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MDM2Q00987 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MDM2Q00987 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MDM2Q00987 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MDM2Q00987 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
MDM2Q00987 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
MDM2Q00987 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
MDM2Q00987 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
MDM2Q00987 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
MDM2Q00987 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
MDM2Q00987 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
MDM2Q00987 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
MDM2Q00987 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
MDM2Q00987 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
MDM2Q00987 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
MDM2Q00987 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
MDM2Q00987 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
MDM2Q00987 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
MDM2Q00987 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
MDM2Q00987 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
MDM2Q00987 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
MDM2Q00987 AC079416.2-201ENST00000625035 1193 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
MDM2Q00987 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
MDM2Q00987 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
MDM2Q00987 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
MDM2Q00987 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
MDM2Q00987 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
MDM2Q00987 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
MDM2Q00987 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
MDM2Q00987 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
MDM2Q00987 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
MDM2Q00987 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MDM2Q00987 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MDM2Q00987 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MDM2Q00987 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms