Protein–RNA interactions for Protein: Q00536

CDK16, Cyclin-dependent kinase 16, humanhuman

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK16Q00536 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDK16Q00536 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDK16Q00536 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CDK16Q00536 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CDK16Q00536 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CDK16Q00536 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDK16Q00536 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDK16Q00536 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CDK16Q00536 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CDK16Q00536 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDK16Q00536 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDK16Q00536 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDK16Q00536 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDK16Q00536 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDK16Q00536 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CDK16Q00536 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CDK16Q00536 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDK16Q00536 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDK16Q00536 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDK16Q00536 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CDK16Q00536 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CDK16Q00536 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDK16Q00536 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDK16Q00536 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDK16Q00536 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDK16Q00536 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDK16Q00536 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CDK16Q00536 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDK16Q00536 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDK16Q00536 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDK16Q00536 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDK16Q00536 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CDK16Q00536 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDK16Q00536 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDK16Q00536 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDK16Q00536 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDK16Q00536 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDK16Q00536 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDK16Q00536 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDK16Q00536 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CDK16Q00536 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDK16Q00536 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDK16Q00536 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDK16Q00536 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDK16Q00536 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDK16Q00536 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDK16Q00536 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDK16Q00536 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDK16Q00536 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDK16Q00536 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDK16Q00536 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDK16Q00536 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDK16Q00536 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDK16Q00536 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDK16Q00536 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDK16Q00536 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDK16Q00536 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDK16Q00536 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDK16Q00536 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDK16Q00536 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDK16Q00536 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDK16Q00536 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDK16Q00536 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDK16Q00536 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDK16Q00536 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDK16Q00536 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDK16Q00536 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDK16Q00536 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDK16Q00536 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDK16Q00536 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDK16Q00536 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDK16Q00536 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDK16Q00536 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDK16Q00536 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDK16Q00536 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDK16Q00536 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDK16Q00536 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDK16Q00536 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDK16Q00536 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDK16Q00536 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDK16Q00536 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDK16Q00536 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CDK16Q00536 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CDK16Q00536 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDK16Q00536 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDK16Q00536 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDK16Q00536 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDK16Q00536 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDK16Q00536 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDK16Q00536 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDK16Q00536 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDK16Q00536 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDK16Q00536 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDK16Q00536 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDK16Q00536 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDK16Q00536 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDK16Q00536 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDK16Q00536 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDK16Q00536 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDK16Q00536 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms