Protein–RNA interactions for Protein: P84550

SKOR1, SKI family transcriptional corepressor 1, humanhuman

Predictions only

Length 965 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKOR1P84550 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SKOR1P84550 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SKOR1P84550 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SKOR1P84550 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SKOR1P84550 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SKOR1P84550 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SKOR1P84550 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SKOR1P84550 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SKOR1P84550 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SKOR1P84550 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SKOR1P84550 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SKOR1P84550 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SKOR1P84550 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SKOR1P84550 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SKOR1P84550 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SKOR1P84550 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SKOR1P84550 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SKOR1P84550 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SKOR1P84550 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SKOR1P84550 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SKOR1P84550 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SKOR1P84550 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SKOR1P84550 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SKOR1P84550 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SKOR1P84550 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SKOR1P84550 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SKOR1P84550 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SKOR1P84550 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SKOR1P84550 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SKOR1P84550 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SKOR1P84550 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SKOR1P84550 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SKOR1P84550 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SKOR1P84550 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SKOR1P84550 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SKOR1P84550 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SKOR1P84550 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SKOR1P84550 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SKOR1P84550 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SKOR1P84550 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SKOR1P84550 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SKOR1P84550 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SKOR1P84550 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SKOR1P84550 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SKOR1P84550 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SKOR1P84550 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SKOR1P84550 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SKOR1P84550 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SKOR1P84550 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SKOR1P84550 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SKOR1P84550 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SKOR1P84550 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SKOR1P84550 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SKOR1P84550 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SKOR1P84550 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SKOR1P84550 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SKOR1P84550 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SKOR1P84550 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SKOR1P84550 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SKOR1P84550 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SKOR1P84550 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SKOR1P84550 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SKOR1P84550 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SKOR1P84550 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SKOR1P84550 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SKOR1P84550 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SKOR1P84550 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SKOR1P84550 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SKOR1P84550 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SKOR1P84550 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SKOR1P84550 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SKOR1P84550 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SKOR1P84550 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SKOR1P84550 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SKOR1P84550 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SKOR1P84550 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SKOR1P84550 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SKOR1P84550 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SKOR1P84550 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SKOR1P84550 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SKOR1P84550 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SKOR1P84550 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SKOR1P84550 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SKOR1P84550 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SKOR1P84550 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SKOR1P84550 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SKOR1P84550 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SKOR1P84550 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SKOR1P84550 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SKOR1P84550 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SKOR1P84550 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SKOR1P84550 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SKOR1P84550 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SKOR1P84550 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SKOR1P84550 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SKOR1P84550 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SKOR1P84550 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SKOR1P84550 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SKOR1P84550 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SKOR1P84550 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms