Protein–RNA interactions for Protein: P78509

RELN, Reelin, humanhuman

Predictions only

Length 3,460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RELNP78509 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RELNP78509 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RELNP78509 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RELNP78509 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RELNP78509 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RELNP78509 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RELNP78509 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RELNP78509 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RELNP78509 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RELNP78509 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RELNP78509 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RELNP78509 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RELNP78509 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RELNP78509 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RELNP78509 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RELNP78509 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RELNP78509 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RELNP78509 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RELNP78509 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RELNP78509 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RELNP78509 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RELNP78509 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RELNP78509 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RELNP78509 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RELNP78509 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RELNP78509 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RELNP78509 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RELNP78509 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RELNP78509 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RELNP78509 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RELNP78509 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RELNP78509 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RELNP78509 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RELNP78509 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RELNP78509 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RELNP78509 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RELNP78509 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RELNP78509 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RELNP78509 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RELNP78509 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RELNP78509 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RELNP78509 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RELNP78509 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RELNP78509 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RELNP78509 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RELNP78509 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RELNP78509 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RELNP78509 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RELNP78509 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RELNP78509 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RELNP78509 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RELNP78509 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RELNP78509 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RELNP78509 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RELNP78509 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RELNP78509 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RELNP78509 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RELNP78509 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RELNP78509 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RELNP78509 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RELNP78509 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RELNP78509 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RELNP78509 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RELNP78509 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RELNP78509 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RELNP78509 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RELNP78509 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RELNP78509 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RELNP78509 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RELNP78509 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RELNP78509 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RELNP78509 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RELNP78509 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RELNP78509 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RELNP78509 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RELNP78509 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RELNP78509 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RELNP78509 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RELNP78509 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RELNP78509 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RELNP78509 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RELNP78509 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RELNP78509 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RELNP78509 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RELNP78509 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RELNP78509 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RELNP78509 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RELNP78509 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RELNP78509 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RELNP78509 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RELNP78509 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RELNP78509 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RELNP78509 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RELNP78509 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RELNP78509 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RELNP78509 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RELNP78509 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RELNP78509 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RELNP78509 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RELNP78509 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms