Protein–RNA interactions for Protein: P78414

IRX1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX1P78414 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
IRX1P78414 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
IRX1P78414 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
IRX1P78414 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
IRX1P78414 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
IRX1P78414 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
IRX1P78414 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
IRX1P78414 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
IRX1P78414 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
IRX1P78414 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
IRX1P78414 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
IRX1P78414 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
IRX1P78414 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
IRX1P78414 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
IRX1P78414 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
IRX1P78414 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
IRX1P78414 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
IRX1P78414 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
IRX1P78414 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
IRX1P78414 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
IRX1P78414 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
IRX1P78414 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
IRX1P78414 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
IRX1P78414 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
IRX1P78414 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
IRX1P78414 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
IRX1P78414 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
IRX1P78414 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
IRX1P78414 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
IRX1P78414 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
IRX1P78414 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
IRX1P78414 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
IRX1P78414 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
IRX1P78414 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
IRX1P78414 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
IRX1P78414 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
IRX1P78414 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
IRX1P78414 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
IRX1P78414 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
IRX1P78414 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
IRX1P78414 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
IRX1P78414 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
IRX1P78414 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
IRX1P78414 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
IRX1P78414 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
IRX1P78414 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
IRX1P78414 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
IRX1P78414 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
IRX1P78414 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
IRX1P78414 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
IRX1P78414 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
IRX1P78414 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
IRX1P78414 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
IRX1P78414 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
IRX1P78414 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
IRX1P78414 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
IRX1P78414 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
IRX1P78414 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
IRX1P78414 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
IRX1P78414 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
IRX1P78414 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
IRX1P78414 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
IRX1P78414 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
IRX1P78414 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
IRX1P78414 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
IRX1P78414 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
IRX1P78414 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
IRX1P78414 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
IRX1P78414 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
IRX1P78414 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
IRX1P78414 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
IRX1P78414 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
IRX1P78414 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
IRX1P78414 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
IRX1P78414 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
IRX1P78414 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
IRX1P78414 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
IRX1P78414 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
IRX1P78414 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
IRX1P78414 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
IRX1P78414 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
IRX1P78414 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
IRX1P78414 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
IRX1P78414 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
IRX1P78414 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
IRX1P78414 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
IRX1P78414 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
IRX1P78414 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
IRX1P78414 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
IRX1P78414 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
IRX1P78414 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
IRX1P78414 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
IRX1P78414 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
IRX1P78414 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
IRX1P78414 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
IRX1P78414 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
IRX1P78414 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
IRX1P78414 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
IRX1P78414 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
IRX1P78414 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms