Protein–RNA interactions for Protein: P62701

RPS4X, 40S ribosomal protein S4, X isoform, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 263 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS4XP62701 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPS4XP62701 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPS4XP62701 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPS4XP62701 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPS4XP62701 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPS4XP62701 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPS4XP62701 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPS4XP62701 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPS4XP62701 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPS4XP62701 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPS4XP62701 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPS4XP62701 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPS4XP62701 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPS4XP62701 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RPS4XP62701 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RPS4XP62701 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RPS4XP62701 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RPS4XP62701 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RPS4XP62701 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RPS4XP62701 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RPS4XP62701 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPS4XP62701 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPS4XP62701 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPS4XP62701 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPS4XP62701 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPS4XP62701 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPS4XP62701 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPS4XP62701 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPS4XP62701 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPS4XP62701 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPS4XP62701 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPS4XP62701 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPS4XP62701 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPS4XP62701 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPS4XP62701 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPS4XP62701 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPS4XP62701 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RPS4XP62701 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPS4XP62701 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPS4XP62701 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPS4XP62701 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPS4XP62701 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RPS4XP62701 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPS4XP62701 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPS4XP62701 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPS4XP62701 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPS4XP62701 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPS4XP62701 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPS4XP62701 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPS4XP62701 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPS4XP62701 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPS4XP62701 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPS4XP62701 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPS4XP62701 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPS4XP62701 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPS4XP62701 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPS4XP62701 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPS4XP62701 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPS4XP62701 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPS4XP62701 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPS4XP62701 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPS4XP62701 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPS4XP62701 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPS4XP62701 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPS4XP62701 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPS4XP62701 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPS4XP62701 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPS4XP62701 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPS4XP62701 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RPS4XP62701 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RPS4XP62701 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPS4XP62701 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPS4XP62701 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPS4XP62701 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPS4XP62701 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPS4XP62701 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPS4XP62701 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPS4XP62701 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPS4XP62701 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPS4XP62701 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPS4XP62701 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPS4XP62701 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPS4XP62701 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPS4XP62701 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPS4XP62701 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPS4XP62701 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPS4XP62701 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPS4XP62701 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPS4XP62701 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPS4XP62701 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPS4XP62701 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPS4XP62701 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPS4XP62701 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPS4XP62701 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPS4XP62701 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPS4XP62701 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPS4XP62701 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPS4XP62701 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPS4XP62701 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPS4XP62701 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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