Protein–RNA interactions for Protein: P52951

GBX2, Homeobox protein GBX-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX2P52951 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GBX2P52951 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GBX2P52951 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GBX2P52951 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GBX2P52951 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GBX2P52951 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GBX2P52951 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GBX2P52951 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GBX2P52951 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GBX2P52951 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GBX2P52951 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GBX2P52951 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GBX2P52951 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GBX2P52951 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GBX2P52951 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GBX2P52951 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GBX2P52951 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GBX2P52951 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GBX2P52951 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GBX2P52951 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GBX2P52951 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GBX2P52951 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GBX2P52951 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GBX2P52951 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GBX2P52951 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GBX2P52951 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GBX2P52951 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
GBX2P52951 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GBX2P52951 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GBX2P52951 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GBX2P52951 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GBX2P52951 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GBX2P52951 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GBX2P52951 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GBX2P52951 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GBX2P52951 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GBX2P52951 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GBX2P52951 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GBX2P52951 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GBX2P52951 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GBX2P52951 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GBX2P52951 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GBX2P52951 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GBX2P52951 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GBX2P52951 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GBX2P52951 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GBX2P52951 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GBX2P52951 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GBX2P52951 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GBX2P52951 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GBX2P52951 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GBX2P52951 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GBX2P52951 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GBX2P52951 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GBX2P52951 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GBX2P52951 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GBX2P52951 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GBX2P52951 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GBX2P52951 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GBX2P52951 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GBX2P52951 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GBX2P52951 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
GBX2P52951 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GBX2P52951 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GBX2P52951 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GBX2P52951 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GBX2P52951 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GBX2P52951 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
GBX2P52951 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GBX2P52951 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GBX2P52951 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GBX2P52951 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GBX2P52951 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GBX2P52951 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GBX2P52951 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GBX2P52951 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GBX2P52951 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GBX2P52951 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GBX2P52951 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GBX2P52951 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GBX2P52951 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GBX2P52951 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GBX2P52951 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GBX2P52951 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GBX2P52951 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GBX2P52951 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GBX2P52951 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GBX2P52951 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GBX2P52951 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GBX2P52951 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GBX2P52951 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GBX2P52951 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GBX2P52951 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GBX2P52951 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GBX2P52951 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GBX2P52951 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GBX2P52951 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GBX2P52951 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GBX2P52951 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GBX2P52951 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms