Protein–RNA interactions for Protein: P49840

GSK3A, Glycogen synthase kinase-3 alpha, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSK3AP49840 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GSK3AP49840 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GSK3AP49840 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GSK3AP49840 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GSK3AP49840 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GSK3AP49840 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GSK3AP49840 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GSK3AP49840 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GSK3AP49840 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GSK3AP49840 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GSK3AP49840 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GSK3AP49840 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GSK3AP49840 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GSK3AP49840 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GSK3AP49840 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GSK3AP49840 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GSK3AP49840 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GSK3AP49840 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GSK3AP49840 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GSK3AP49840 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GSK3AP49840 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GSK3AP49840 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GSK3AP49840 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GSK3AP49840 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GSK3AP49840 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GSK3AP49840 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GSK3AP49840 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GSK3AP49840 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GSK3AP49840 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GSK3AP49840 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GSK3AP49840 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GSK3AP49840 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GSK3AP49840 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GSK3AP49840 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GSK3AP49840 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GSK3AP49840 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GSK3AP49840 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GSK3AP49840 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GSK3AP49840 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GSK3AP49840 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GSK3AP49840 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GSK3AP49840 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GSK3AP49840 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GSK3AP49840 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GSK3AP49840 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GSK3AP49840 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GSK3AP49840 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GSK3AP49840 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GSK3AP49840 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GSK3AP49840 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GSK3AP49840 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GSK3AP49840 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GSK3AP49840 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GSK3AP49840 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GSK3AP49840 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GSK3AP49840 DCD-201ENST00000293371 645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GSK3AP49840 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GSK3AP49840 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GSK3AP49840 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GSK3AP49840 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GSK3AP49840 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GSK3AP49840 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GSK3AP49840 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GSK3AP49840 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GSK3AP49840 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GSK3AP49840 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GSK3AP49840 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GSK3AP49840 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GSK3AP49840 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GSK3AP49840 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GSK3AP49840 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GSK3AP49840 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GSK3AP49840 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GSK3AP49840 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GSK3AP49840 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GSK3AP49840 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GSK3AP49840 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GSK3AP49840 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GSK3AP49840 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GSK3AP49840 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GSK3AP49840 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GSK3AP49840 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GSK3AP49840 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GSK3AP49840 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GSK3AP49840 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GSK3AP49840 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GSK3AP49840 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GSK3AP49840 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GSK3AP49840 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GSK3AP49840 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GSK3AP49840 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GSK3AP49840 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GSK3AP49840 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GSK3AP49840 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GSK3AP49840 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GSK3AP49840 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GSK3AP49840 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GSK3AP49840 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GSK3AP49840 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GSK3AP49840 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms