Protein–RNA interactions for Protein: P49790

NUP153, Nuclear pore complex protein Nup153, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP153P49790 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NUP153P49790 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NUP153P49790 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NUP153P49790 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
NUP153P49790 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
NUP153P49790 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NUP153P49790 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NUP153P49790 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NUP153P49790 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NUP153P49790 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NUP153P49790 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NUP153P49790 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NUP153P49790 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
NUP153P49790 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NUP153P49790 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NUP153P49790 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NUP153P49790 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
NUP153P49790 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NUP153P49790 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NUP153P49790 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NUP153P49790 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NUP153P49790 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NUP153P49790 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
NUP153P49790 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NUP153P49790 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NUP153P49790 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NUP153P49790 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NUP153P49790 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NUP153P49790 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NUP153P49790 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NUP153P49790 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
NUP153P49790 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
NUP153P49790 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NUP153P49790 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NUP153P49790 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NUP153P49790 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NUP153P49790 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NUP153P49790 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NUP153P49790 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NUP153P49790 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NUP153P49790 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NUP153P49790 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NUP153P49790 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
NUP153P49790 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NUP153P49790 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NUP153P49790 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
NUP153P49790 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NUP153P49790 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NUP153P49790 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NUP153P49790 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NUP153P49790 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NUP153P49790 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
NUP153P49790 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NUP153P49790 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NUP153P49790 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NUP153P49790 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NUP153P49790 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NUP153P49790 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NUP153P49790 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NUP153P49790 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NUP153P49790 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NUP153P49790 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
NUP153P49790 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NUP153P49790 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NUP153P49790 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NUP153P49790 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NUP153P49790 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NUP153P49790 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NUP153P49790 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
NUP153P49790 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NUP153P49790 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NUP153P49790 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
NUP153P49790 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NUP153P49790 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NUP153P49790 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NUP153P49790 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NUP153P49790 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NUP153P49790 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NUP153P49790 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NUP153P49790 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NUP153P49790 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NUP153P49790 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NUP153P49790 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NUP153P49790 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NUP153P49790 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NUP153P49790 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NUP153P49790 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NUP153P49790 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NUP153P49790 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NUP153P49790 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NUP153P49790 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NUP153P49790 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NUP153P49790 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NUP153P49790 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NUP153P49790 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NUP153P49790 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
NUP153P49790 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NUP153P49790 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
NUP153P49790 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NUP153P49790 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms