Protein–RNA interactions for Protein: P48426

PIP4K2A, Phosphatidylinositol 5-phosphate 4-kinase type-2 alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIP4K2AP48426 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PIP4K2AP48426 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PIP4K2AP48426 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PIP4K2AP48426 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PIP4K2AP48426 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PIP4K2AP48426 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PIP4K2AP48426 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PIP4K2AP48426 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PIP4K2AP48426 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PIP4K2AP48426 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PIP4K2AP48426 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PIP4K2AP48426 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PIP4K2AP48426 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PIP4K2AP48426 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PIP4K2AP48426 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PIP4K2AP48426 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PIP4K2AP48426 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PIP4K2AP48426 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PIP4K2AP48426 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PIP4K2AP48426 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PIP4K2AP48426 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PIP4K2AP48426 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PIP4K2AP48426 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PIP4K2AP48426 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PIP4K2AP48426 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PIP4K2AP48426 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PIP4K2AP48426 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PIP4K2AP48426 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PIP4K2AP48426 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PIP4K2AP48426 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PIP4K2AP48426 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PIP4K2AP48426 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PIP4K2AP48426 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PIP4K2AP48426 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PIP4K2AP48426 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PIP4K2AP48426 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PIP4K2AP48426 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PIP4K2AP48426 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PIP4K2AP48426 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PIP4K2AP48426 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PIP4K2AP48426 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PIP4K2AP48426 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PIP4K2AP48426 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PIP4K2AP48426 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PIP4K2AP48426 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PIP4K2AP48426 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PIP4K2AP48426 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PIP4K2AP48426 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PIP4K2AP48426 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PIP4K2AP48426 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PIP4K2AP48426 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PIP4K2AP48426 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PIP4K2AP48426 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PIP4K2AP48426 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PIP4K2AP48426 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PIP4K2AP48426 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PIP4K2AP48426 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PIP4K2AP48426 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PIP4K2AP48426 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PIP4K2AP48426 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PIP4K2AP48426 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PIP4K2AP48426 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PIP4K2AP48426 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PIP4K2AP48426 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PIP4K2AP48426 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PIP4K2AP48426 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PIP4K2AP48426 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PIP4K2AP48426 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PIP4K2AP48426 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PIP4K2AP48426 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PIP4K2AP48426 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PIP4K2AP48426 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PIP4K2AP48426 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PIP4K2AP48426 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PIP4K2AP48426 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PIP4K2AP48426 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PIP4K2AP48426 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PIP4K2AP48426 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PIP4K2AP48426 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PIP4K2AP48426 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PIP4K2AP48426 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PIP4K2AP48426 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PIP4K2AP48426 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PIP4K2AP48426 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PIP4K2AP48426 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PIP4K2AP48426 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PIP4K2AP48426 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PIP4K2AP48426 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PIP4K2AP48426 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PIP4K2AP48426 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PIP4K2AP48426 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PIP4K2AP48426 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PIP4K2AP48426 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PIP4K2AP48426 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PIP4K2AP48426 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PIP4K2AP48426 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PIP4K2AP48426 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PIP4K2AP48426 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PIP4K2AP48426 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PIP4K2AP48426 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms