Protein–RNA interactions for Protein: P35244

RPA3, Replication protein A 14 kDa subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA3P35244 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RPA3P35244 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RPA3P35244 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RPA3P35244 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RPA3P35244 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RPA3P35244 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RPA3P35244 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RPA3P35244 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RPA3P35244 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RPA3P35244 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RPA3P35244 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RPA3P35244 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RPA3P35244 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RPA3P35244 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RPA3P35244 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
RPA3P35244 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
RPA3P35244 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RPA3P35244 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
RPA3P35244 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RPA3P35244 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RPA3P35244 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RPA3P35244 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RPA3P35244 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RPA3P35244 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RPA3P35244 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RPA3P35244 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RPA3P35244 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RPA3P35244 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RPA3P35244 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RPA3P35244 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RPA3P35244 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RPA3P35244 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RPA3P35244 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RPA3P35244 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPA3P35244 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPA3P35244 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPA3P35244 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPA3P35244 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPA3P35244 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPA3P35244 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPA3P35244 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPA3P35244 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPA3P35244 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPA3P35244 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPA3P35244 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPA3P35244 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPA3P35244 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPA3P35244 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPA3P35244 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPA3P35244 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPA3P35244 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
RPA3P35244 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPA3P35244 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPA3P35244 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPA3P35244 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
RPA3P35244 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPA3P35244 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPA3P35244 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPA3P35244 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPA3P35244 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPA3P35244 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
RPA3P35244 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
RPA3P35244 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPA3P35244 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPA3P35244 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPA3P35244 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPA3P35244 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPA3P35244 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPA3P35244 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPA3P35244 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPA3P35244 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
RPA3P35244 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPA3P35244 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPA3P35244 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RPA3P35244 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RPA3P35244 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RPA3P35244 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RPA3P35244 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RPA3P35244 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RPA3P35244 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RPA3P35244 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RPA3P35244 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RPA3P35244 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RPA3P35244 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RPA3P35244 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
RPA3P35244 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RPA3P35244 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RPA3P35244 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RPA3P35244 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
RPA3P35244 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RPA3P35244 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RPA3P35244 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
RPA3P35244 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RPA3P35244 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RPA3P35244 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RPA3P35244 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RPA3P35244 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
RPA3P35244 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RPA3P35244 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RPA3P35244 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms