Protein–RNA interactions for Protein: P31941

APOBEC3A, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3AP31941 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
APOBEC3AP31941 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APOBEC3AP31941 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
APOBEC3AP31941 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
APOBEC3AP31941 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
APOBEC3AP31941 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APOBEC3AP31941 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
APOBEC3AP31941 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
APOBEC3AP31941 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
APOBEC3AP31941 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
APOBEC3AP31941 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
APOBEC3AP31941 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
APOBEC3AP31941 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
APOBEC3AP31941 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
APOBEC3AP31941 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
APOBEC3AP31941 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.05■□□□□ 0
APOBEC3AP31941 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC15.05■□□□□ -0
APOBEC3AP31941 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
APOBEC3AP31941 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
APOBEC3AP31941 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
APOBEC3AP31941 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
APOBEC3AP31941 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC15.05■□□□□ -0
APOBEC3AP31941 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC15.05■□□□□ -0
APOBEC3AP31941 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
APOBEC3AP31941 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
APOBEC3AP31941 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC15.05■□□□□ -0
APOBEC3AP31941 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
APOBEC3AP31941 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC15.05■□□□□ -0
APOBEC3AP31941 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
APOBEC3AP31941 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
APOBEC3AP31941 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
APOBEC3AP31941 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
APOBEC3AP31941 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
APOBEC3AP31941 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
APOBEC3AP31941 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
APOBEC3AP31941 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
APOBEC3AP31941 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
APOBEC3AP31941 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
APOBEC3AP31941 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
APOBEC3AP31941 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
APOBEC3AP31941 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
APOBEC3AP31941 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
APOBEC3AP31941 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
APOBEC3AP31941 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
APOBEC3AP31941 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
APOBEC3AP31941 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
APOBEC3AP31941 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
APOBEC3AP31941 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
APOBEC3AP31941 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
APOBEC3AP31941 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
APOBEC3AP31941 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
APOBEC3AP31941 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
APOBEC3AP31941 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC15.04■□□□□ -0
APOBEC3AP31941 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
APOBEC3AP31941 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
APOBEC3AP31941 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
APOBEC3AP31941 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
APOBEC3AP31941 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC15.04■□□□□ -0
APOBEC3AP31941 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
APOBEC3AP31941 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC15.04■□□□□ -0
APOBEC3AP31941 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
APOBEC3AP31941 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
APOBEC3AP31941 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
APOBEC3AP31941 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
APOBEC3AP31941 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
APOBEC3AP31941 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC15.04■□□□□ -0
APOBEC3AP31941 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
APOBEC3AP31941 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
APOBEC3AP31941 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
APOBEC3AP31941 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
APOBEC3AP31941 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
APOBEC3AP31941 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
APOBEC3AP31941 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
APOBEC3AP31941 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
APOBEC3AP31941 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
APOBEC3AP31941 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
APOBEC3AP31941 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
APOBEC3AP31941 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
APOBEC3AP31941 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
APOBEC3AP31941 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
APOBEC3AP31941 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
APOBEC3AP31941 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
APOBEC3AP31941 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
APOBEC3AP31941 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
APOBEC3AP31941 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
APOBEC3AP31941 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
APOBEC3AP31941 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
APOBEC3AP31941 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
APOBEC3AP31941 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
APOBEC3AP31941 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
APOBEC3AP31941 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
APOBEC3AP31941 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
APOBEC3AP31941 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
APOBEC3AP31941 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
APOBEC3AP31941 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC15.03■□□□□ -0
APOBEC3AP31941 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
APOBEC3AP31941 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
APOBEC3AP31941 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
APOBEC3AP31941 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC15.03■□□□□ -0
APOBEC3AP31941 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms