Protein–RNA interactions for Protein: P31268

HOXA7, Homeobox protein Hox-A7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA7P31268 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXA7P31268 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXA7P31268 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXA7P31268 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXA7P31268 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXA7P31268 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXA7P31268 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXA7P31268 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXA7P31268 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXA7P31268 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXA7P31268 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXA7P31268 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXA7P31268 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXA7P31268 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXA7P31268 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXA7P31268 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXA7P31268 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXA7P31268 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXA7P31268 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXA7P31268 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXA7P31268 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXA7P31268 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXA7P31268 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXA7P31268 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXA7P31268 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXA7P31268 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXA7P31268 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXA7P31268 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXA7P31268 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXA7P31268 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXA7P31268 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXA7P31268 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXA7P31268 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXA7P31268 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXA7P31268 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXA7P31268 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXA7P31268 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXA7P31268 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXA7P31268 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXA7P31268 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXA7P31268 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXA7P31268 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXA7P31268 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXA7P31268 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXA7P31268 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXA7P31268 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXA7P31268 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXA7P31268 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXA7P31268 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXA7P31268 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXA7P31268 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXA7P31268 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXA7P31268 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXA7P31268 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXA7P31268 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXA7P31268 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXA7P31268 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXA7P31268 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXA7P31268 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXA7P31268 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXA7P31268 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXA7P31268 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXA7P31268 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXA7P31268 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXA7P31268 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXA7P31268 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXA7P31268 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXA7P31268 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXA7P31268 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXA7P31268 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXA7P31268 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXA7P31268 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXA7P31268 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXA7P31268 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXA7P31268 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXA7P31268 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXA7P31268 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXA7P31268 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXA7P31268 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXA7P31268 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXA7P31268 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXA7P31268 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXA7P31268 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXA7P31268 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXA7P31268 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXA7P31268 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXA7P31268 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXA7P31268 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXA7P31268 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXA7P31268 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXA7P31268 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXA7P31268 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXA7P31268 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXA7P31268 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXA7P31268 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXA7P31268 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXA7P31268 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXA7P31268 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXA7P31268 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXA7P31268 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms