Protein–RNA interactions for Protein: P30049

ATP5D, ATP synthase subunit delta, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5DP30049 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP5DP30049 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP5DP30049 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP5DP30049 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP5DP30049 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP5DP30049 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP5DP30049 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP5DP30049 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP5DP30049 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP5DP30049 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP5DP30049 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP5DP30049 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP5DP30049 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP5DP30049 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP5DP30049 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP5DP30049 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP5DP30049 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP5DP30049 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP5DP30049 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP5DP30049 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP5DP30049 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP5DP30049 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP5DP30049 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP5DP30049 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP5DP30049 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP5DP30049 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP5DP30049 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP5DP30049 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP5DP30049 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP5DP30049 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP5DP30049 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP5DP30049 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP5DP30049 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP5DP30049 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP5DP30049 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP5DP30049 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP5DP30049 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP5DP30049 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP5DP30049 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP5DP30049 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP5DP30049 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP5DP30049 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP5DP30049 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP5DP30049 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP5DP30049 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP5DP30049 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP5DP30049 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP5DP30049 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP5DP30049 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP5DP30049 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP5DP30049 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP5DP30049 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP5DP30049 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP5DP30049 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP5DP30049 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP5DP30049 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP5DP30049 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP5DP30049 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP5DP30049 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP5DP30049 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP5DP30049 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP5DP30049 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP5DP30049 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP5DP30049 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP5DP30049 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP5DP30049 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP5DP30049 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP5DP30049 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP5DP30049 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP5DP30049 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP5DP30049 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP5DP30049 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP5DP30049 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP5DP30049 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP5DP30049 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP5DP30049 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP5DP30049 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP5DP30049 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP5DP30049 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP5DP30049 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP5DP30049 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP5DP30049 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP5DP30049 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP5DP30049 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP5DP30049 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP5DP30049 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP5DP30049 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP5DP30049 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP5DP30049 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP5DP30049 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP5DP30049 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP5DP30049 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP5DP30049 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP5DP30049 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP5DP30049 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP5DP30049 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP5DP30049 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP5DP30049 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP5DP30049 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP5DP30049 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms