Protein–RNA interactions for Protein: P28472

GABRB3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB3P28472 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GABRB3P28472 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GABRB3P28472 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GABRB3P28472 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GABRB3P28472 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GABRB3P28472 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GABRB3P28472 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GABRB3P28472 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
GABRB3P28472 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
GABRB3P28472 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GABRB3P28472 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GABRB3P28472 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GABRB3P28472 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GABRB3P28472 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GABRB3P28472 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GABRB3P28472 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GABRB3P28472 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GABRB3P28472 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GABRB3P28472 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GABRB3P28472 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GABRB3P28472 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GABRB3P28472 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GABRB3P28472 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GABRB3P28472 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GABRB3P28472 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GABRB3P28472 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GABRB3P28472 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GABRB3P28472 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GABRB3P28472 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GABRB3P28472 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GABRB3P28472 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GABRB3P28472 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GABRB3P28472 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GABRB3P28472 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GABRB3P28472 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GABRB3P28472 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
GABRB3P28472 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GABRB3P28472 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GABRB3P28472 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GABRB3P28472 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GABRB3P28472 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GABRB3P28472 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GABRB3P28472 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GABRB3P28472 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GABRB3P28472 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GABRB3P28472 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GABRB3P28472 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GABRB3P28472 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GABRB3P28472 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GABRB3P28472 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GABRB3P28472 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GABRB3P28472 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GABRB3P28472 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GABRB3P28472 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GABRB3P28472 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GABRB3P28472 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GABRB3P28472 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GABRB3P28472 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GABRB3P28472 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GABRB3P28472 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GABRB3P28472 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GABRB3P28472 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GABRB3P28472 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GABRB3P28472 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GABRB3P28472 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GABRB3P28472 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GABRB3P28472 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GABRB3P28472 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GABRB3P28472 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GABRB3P28472 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GABRB3P28472 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GABRB3P28472 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GABRB3P28472 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GABRB3P28472 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GABRB3P28472 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GABRB3P28472 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GABRB3P28472 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GABRB3P28472 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GABRB3P28472 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GABRB3P28472 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
GABRB3P28472 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GABRB3P28472 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GABRB3P28472 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
GABRB3P28472 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
GABRB3P28472 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GABRB3P28472 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GABRB3P28472 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GABRB3P28472 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GABRB3P28472 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GABRB3P28472 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GABRB3P28472 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
GABRB3P28472 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
GABRB3P28472 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GABRB3P28472 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GABRB3P28472 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GABRB3P28472 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GABRB3P28472 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GABRB3P28472 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GABRB3P28472 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GABRB3P28472 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms