Protein–RNA interactions for Protein: P20827

EFNA1, Ephrin-A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA1P20827 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
EFNA1P20827 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
EFNA1P20827 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
EFNA1P20827 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
EFNA1P20827 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
EFNA1P20827 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
EFNA1P20827 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
EFNA1P20827 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
EFNA1P20827 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
EFNA1P20827 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
EFNA1P20827 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
EFNA1P20827 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
EFNA1P20827 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
EFNA1P20827 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
EFNA1P20827 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
EFNA1P20827 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
EFNA1P20827 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
EFNA1P20827 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
EFNA1P20827 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
EFNA1P20827 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
EFNA1P20827 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
EFNA1P20827 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
EFNA1P20827 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
EFNA1P20827 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
EFNA1P20827 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
EFNA1P20827 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
EFNA1P20827 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
EFNA1P20827 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
EFNA1P20827 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
EFNA1P20827 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
EFNA1P20827 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
EFNA1P20827 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
EFNA1P20827 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
EFNA1P20827 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
EFNA1P20827 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
EFNA1P20827 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
EFNA1P20827 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
EFNA1P20827 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
EFNA1P20827 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
EFNA1P20827 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
EFNA1P20827 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
EFNA1P20827 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
EFNA1P20827 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
EFNA1P20827 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
EFNA1P20827 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
EFNA1P20827 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
EFNA1P20827 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
EFNA1P20827 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
EFNA1P20827 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
EFNA1P20827 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
EFNA1P20827 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
EFNA1P20827 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
EFNA1P20827 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
EFNA1P20827 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
EFNA1P20827 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
EFNA1P20827 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
EFNA1P20827 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
EFNA1P20827 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
EFNA1P20827 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
EFNA1P20827 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
EFNA1P20827 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
EFNA1P20827 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
EFNA1P20827 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
EFNA1P20827 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
EFNA1P20827 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
EFNA1P20827 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
EFNA1P20827 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
EFNA1P20827 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
EFNA1P20827 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
EFNA1P20827 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
EFNA1P20827 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
EFNA1P20827 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
EFNA1P20827 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
EFNA1P20827 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
EFNA1P20827 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
EFNA1P20827 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
EFNA1P20827 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
EFNA1P20827 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
EFNA1P20827 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
EFNA1P20827 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
EFNA1P20827 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
EFNA1P20827 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
EFNA1P20827 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
EFNA1P20827 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
EFNA1P20827 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
EFNA1P20827 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
EFNA1P20827 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
EFNA1P20827 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
EFNA1P20827 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
EFNA1P20827 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
EFNA1P20827 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
EFNA1P20827 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
EFNA1P20827 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
EFNA1P20827 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
EFNA1P20827 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
EFNA1P20827 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
EFNA1P20827 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
EFNA1P20827 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
EFNA1P20827 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
EFNA1P20827 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms