Protein–RNA interactions for Protein: P20248

CCNA2, Cyclin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA2P20248 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCNA2P20248 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCNA2P20248 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCNA2P20248 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCNA2P20248 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCNA2P20248 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCNA2P20248 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCNA2P20248 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCNA2P20248 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCNA2P20248 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCNA2P20248 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCNA2P20248 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCNA2P20248 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCNA2P20248 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCNA2P20248 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCNA2P20248 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCNA2P20248 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCNA2P20248 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCNA2P20248 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CCNA2P20248 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CCNA2P20248 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCNA2P20248 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCNA2P20248 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCNA2P20248 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCNA2P20248 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCNA2P20248 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCNA2P20248 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCNA2P20248 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCNA2P20248 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCNA2P20248 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCNA2P20248 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCNA2P20248 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCNA2P20248 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CCNA2P20248 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CCNA2P20248 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCNA2P20248 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CCNA2P20248 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CCNA2P20248 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCNA2P20248 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCNA2P20248 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCNA2P20248 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCNA2P20248 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCNA2P20248 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCNA2P20248 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCNA2P20248 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCNA2P20248 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCNA2P20248 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCNA2P20248 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CCNA2P20248 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCNA2P20248 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCNA2P20248 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCNA2P20248 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCNA2P20248 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCNA2P20248 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCNA2P20248 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCNA2P20248 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCNA2P20248 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCNA2P20248 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCNA2P20248 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCNA2P20248 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCNA2P20248 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CCNA2P20248 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CCNA2P20248 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCNA2P20248 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCNA2P20248 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCNA2P20248 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCNA2P20248 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCNA2P20248 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CCNA2P20248 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CCNA2P20248 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCNA2P20248 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCNA2P20248 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCNA2P20248 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCNA2P20248 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCNA2P20248 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCNA2P20248 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCNA2P20248 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCNA2P20248 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCNA2P20248 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCNA2P20248 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCNA2P20248 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCNA2P20248 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCNA2P20248 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCNA2P20248 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCNA2P20248 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCNA2P20248 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCNA2P20248 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCNA2P20248 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCNA2P20248 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCNA2P20248 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCNA2P20248 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCNA2P20248 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCNA2P20248 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCNA2P20248 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCNA2P20248 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCNA2P20248 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCNA2P20248 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCNA2P20248 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCNA2P20248 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCNA2P20248 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms