Protein–RNA interactions for Protein: P17947

SPI1, Transcription factor PU.1, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPI1P17947 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPI1P17947 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPI1P17947 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPI1P17947 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPI1P17947 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPI1P17947 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPI1P17947 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPI1P17947 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPI1P17947 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPI1P17947 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPI1P17947 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SPI1P17947 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPI1P17947 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPI1P17947 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPI1P17947 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPI1P17947 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPI1P17947 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPI1P17947 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPI1P17947 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPI1P17947 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPI1P17947 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPI1P17947 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPI1P17947 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPI1P17947 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPI1P17947 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPI1P17947 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SPI1P17947 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPI1P17947 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPI1P17947 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPI1P17947 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPI1P17947 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPI1P17947 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPI1P17947 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPI1P17947 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPI1P17947 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SPI1P17947 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPI1P17947 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPI1P17947 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPI1P17947 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SPI1P17947 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SPI1P17947 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SPI1P17947 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SPI1P17947 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPI1P17947 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SPI1P17947 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPI1P17947 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPI1P17947 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPI1P17947 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPI1P17947 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPI1P17947 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPI1P17947 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPI1P17947 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPI1P17947 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPI1P17947 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPI1P17947 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPI1P17947 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPI1P17947 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPI1P17947 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPI1P17947 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPI1P17947 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPI1P17947 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPI1P17947 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPI1P17947 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPI1P17947 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPI1P17947 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SPI1P17947 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPI1P17947 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SPI1P17947 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPI1P17947 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SPI1P17947 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPI1P17947 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPI1P17947 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SPI1P17947 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPI1P17947 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPI1P17947 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPI1P17947 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPI1P17947 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPI1P17947 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPI1P17947 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPI1P17947 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPI1P17947 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPI1P17947 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPI1P17947 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPI1P17947 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPI1P17947 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPI1P17947 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPI1P17947 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPI1P17947 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPI1P17947 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPI1P17947 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPI1P17947 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPI1P17947 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPI1P17947 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPI1P17947 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPI1P17947 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPI1P17947 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPI1P17947 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPI1P17947 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPI1P17947 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPI1P17947 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms