Protein–RNA interactions for Protein: P13569

CFTR, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, humanhuman

Predictions only

Length 1,480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFTRP13569 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CFTRP13569 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CFTRP13569 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CFTRP13569 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CFTRP13569 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CFTRP13569 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CFTRP13569 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CFTRP13569 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
CFTRP13569 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
CFTRP13569 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
CFTRP13569 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
CFTRP13569 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
CFTRP13569 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC29.95■■■□□ 2.39
CFTRP13569 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
CFTRP13569 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
CFTRP13569 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
CFTRP13569 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
CFTRP13569 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
CFTRP13569 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
CFTRP13569 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CFTRP13569 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CFTRP13569 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CFTRP13569 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CFTRP13569 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
CFTRP13569 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CFTRP13569 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CFTRP13569 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CFTRP13569 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CFTRP13569 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CFTRP13569 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CFTRP13569 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CFTRP13569 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CFTRP13569 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
CFTRP13569 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CFTRP13569 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CFTRP13569 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CFTRP13569 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CFTRP13569 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CFTRP13569 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CFTRP13569 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CFTRP13569 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CFTRP13569 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CFTRP13569 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CFTRP13569 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CFTRP13569 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CFTRP13569 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CFTRP13569 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CFTRP13569 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CFTRP13569 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CFTRP13569 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CFTRP13569 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CFTRP13569 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CFTRP13569 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CFTRP13569 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
CFTRP13569 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CFTRP13569 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
CFTRP13569 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CFTRP13569 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CFTRP13569 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
CFTRP13569 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CFTRP13569 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CFTRP13569 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CFTRP13569 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CFTRP13569 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CFTRP13569 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CFTRP13569 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CFTRP13569 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CFTRP13569 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CFTRP13569 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CFTRP13569 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CFTRP13569 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CFTRP13569 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CFTRP13569 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CFTRP13569 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CFTRP13569 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CFTRP13569 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CFTRP13569 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CFTRP13569 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CFTRP13569 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CFTRP13569 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
CFTRP13569 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CFTRP13569 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CFTRP13569 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CFTRP13569 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CFTRP13569 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CFTRP13569 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CFTRP13569 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
CFTRP13569 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CFTRP13569 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
CFTRP13569 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
CFTRP13569 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CFTRP13569 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
CFTRP13569 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
CFTRP13569 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
CFTRP13569 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
CFTRP13569 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC29.89■■■□□ 2.38
CFTRP13569 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CFTRP13569 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
CFTRP13569 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.37
CFTRP13569 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms