Protein–RNA interactions for Protein: P12830

CDH1, Cadherin-1, humanhuman

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH1P12830 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CDH1P12830 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CDH1P12830 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CDH1P12830 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CDH1P12830 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CDH1P12830 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CDH1P12830 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CDH1P12830 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CDH1P12830 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CDH1P12830 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CDH1P12830 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CDH1P12830 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CDH1P12830 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CDH1P12830 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CDH1P12830 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CDH1P12830 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CDH1P12830 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CDH1P12830 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CDH1P12830 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CDH1P12830 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CDH1P12830 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CDH1P12830 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CDH1P12830 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CDH1P12830 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CDH1P12830 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CDH1P12830 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CDH1P12830 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CDH1P12830 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CDH1P12830 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CDH1P12830 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CDH1P12830 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CDH1P12830 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CDH1P12830 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CDH1P12830 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CDH1P12830 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CDH1P12830 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CDH1P12830 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDH1P12830 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDH1P12830 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDH1P12830 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDH1P12830 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDH1P12830 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDH1P12830 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDH1P12830 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDH1P12830 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDH1P12830 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDH1P12830 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDH1P12830 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDH1P12830 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDH1P12830 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDH1P12830 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDH1P12830 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDH1P12830 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CDH1P12830 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDH1P12830 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CDH1P12830 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDH1P12830 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDH1P12830 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDH1P12830 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDH1P12830 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDH1P12830 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDH1P12830 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDH1P12830 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDH1P12830 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDH1P12830 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDH1P12830 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDH1P12830 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDH1P12830 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDH1P12830 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDH1P12830 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDH1P12830 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDH1P12830 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDH1P12830 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDH1P12830 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDH1P12830 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CDH1P12830 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDH1P12830 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDH1P12830 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDH1P12830 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDH1P12830 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDH1P12830 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDH1P12830 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDH1P12830 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDH1P12830 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDH1P12830 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDH1P12830 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDH1P12830 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDH1P12830 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CDH1P12830 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDH1P12830 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDH1P12830 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CDH1P12830 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDH1P12830 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDH1P12830 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDH1P12830 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDH1P12830 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDH1P12830 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDH1P12830 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDH1P12830 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDH1P12830 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms