Protein–RNA interactions for Protein: P0DN76

U2AF1L5, Splicing factor U2AF 35 kDa subunit-like protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2AF1L5P0DN76 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
U2AF1L5P0DN76 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
U2AF1L5P0DN76 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
U2AF1L5P0DN76 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
U2AF1L5P0DN76 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
U2AF1L5P0DN76 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
U2AF1L5P0DN76 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
U2AF1L5P0DN76 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
U2AF1L5P0DN76 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
U2AF1L5P0DN76 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
U2AF1L5P0DN76 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
U2AF1L5P0DN76 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
U2AF1L5P0DN76 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
U2AF1L5P0DN76 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
U2AF1L5P0DN76 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
U2AF1L5P0DN76 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
U2AF1L5P0DN76 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
U2AF1L5P0DN76 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
U2AF1L5P0DN76 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
U2AF1L5P0DN76 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
U2AF1L5P0DN76 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
U2AF1L5P0DN76 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
U2AF1L5P0DN76 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
U2AF1L5P0DN76 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
U2AF1L5P0DN76 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
U2AF1L5P0DN76 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
U2AF1L5P0DN76 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
U2AF1L5P0DN76 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
U2AF1L5P0DN76 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
U2AF1L5P0DN76 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
U2AF1L5P0DN76 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
U2AF1L5P0DN76 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
U2AF1L5P0DN76 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
U2AF1L5P0DN76 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
U2AF1L5P0DN76 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
U2AF1L5P0DN76 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
U2AF1L5P0DN76 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
U2AF1L5P0DN76 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
U2AF1L5P0DN76 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
U2AF1L5P0DN76 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
U2AF1L5P0DN76 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
U2AF1L5P0DN76 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
U2AF1L5P0DN76 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
U2AF1L5P0DN76 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
U2AF1L5P0DN76 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
U2AF1L5P0DN76 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
U2AF1L5P0DN76 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
U2AF1L5P0DN76 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
U2AF1L5P0DN76 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
U2AF1L5P0DN76 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
U2AF1L5P0DN76 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
U2AF1L5P0DN76 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
U2AF1L5P0DN76 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
U2AF1L5P0DN76 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
U2AF1L5P0DN76 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
U2AF1L5P0DN76 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
U2AF1L5P0DN76 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
U2AF1L5P0DN76 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
U2AF1L5P0DN76 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
U2AF1L5P0DN76 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
U2AF1L5P0DN76 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
U2AF1L5P0DN76 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
U2AF1L5P0DN76 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
U2AF1L5P0DN76 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
U2AF1L5P0DN76 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
U2AF1L5P0DN76 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
U2AF1L5P0DN76 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
U2AF1L5P0DN76 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
U2AF1L5P0DN76 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
U2AF1L5P0DN76 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
U2AF1L5P0DN76 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
U2AF1L5P0DN76 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
U2AF1L5P0DN76 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
U2AF1L5P0DN76 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
U2AF1L5P0DN76 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
U2AF1L5P0DN76 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
U2AF1L5P0DN76 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
U2AF1L5P0DN76 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
U2AF1L5P0DN76 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
U2AF1L5P0DN76 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
U2AF1L5P0DN76 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
U2AF1L5P0DN76 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
U2AF1L5P0DN76 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
U2AF1L5P0DN76 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
U2AF1L5P0DN76 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
U2AF1L5P0DN76 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
U2AF1L5P0DN76 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
U2AF1L5P0DN76 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
U2AF1L5P0DN76 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
U2AF1L5P0DN76 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
U2AF1L5P0DN76 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
U2AF1L5P0DN76 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
U2AF1L5P0DN76 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
U2AF1L5P0DN76 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
U2AF1L5P0DN76 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
U2AF1L5P0DN76 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
U2AF1L5P0DN76 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
U2AF1L5P0DN76 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
U2AF1L5P0DN76 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
U2AF1L5P0DN76 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms