Protein–RNA interactions for Protein: O94813

SLIT2, Slit homolog 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLIT2O94813 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLIT2O94813 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLIT2O94813 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SLIT2O94813 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLIT2O94813 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLIT2O94813 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLIT2O94813 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLIT2O94813 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLIT2O94813 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLIT2O94813 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLIT2O94813 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLIT2O94813 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLIT2O94813 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLIT2O94813 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLIT2O94813 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SLIT2O94813 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLIT2O94813 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLIT2O94813 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLIT2O94813 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLIT2O94813 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLIT2O94813 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLIT2O94813 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLIT2O94813 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLIT2O94813 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLIT2O94813 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLIT2O94813 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLIT2O94813 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLIT2O94813 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLIT2O94813 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLIT2O94813 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLIT2O94813 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLIT2O94813 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLIT2O94813 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLIT2O94813 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLIT2O94813 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLIT2O94813 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLIT2O94813 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLIT2O94813 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLIT2O94813 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SLIT2O94813 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLIT2O94813 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLIT2O94813 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLIT2O94813 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLIT2O94813 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLIT2O94813 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLIT2O94813 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLIT2O94813 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SLIT2O94813 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLIT2O94813 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLIT2O94813 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLIT2O94813 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLIT2O94813 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLIT2O94813 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLIT2O94813 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLIT2O94813 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLIT2O94813 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SLIT2O94813 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLIT2O94813 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLIT2O94813 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLIT2O94813 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLIT2O94813 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLIT2O94813 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLIT2O94813 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLIT2O94813 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SLIT2O94813 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SLIT2O94813 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLIT2O94813 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLIT2O94813 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLIT2O94813 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SLIT2O94813 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLIT2O94813 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLIT2O94813 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLIT2O94813 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLIT2O94813 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLIT2O94813 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLIT2O94813 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLIT2O94813 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLIT2O94813 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLIT2O94813 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SLIT2O94813 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLIT2O94813 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLIT2O94813 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLIT2O94813 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLIT2O94813 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLIT2O94813 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLIT2O94813 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLIT2O94813 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLIT2O94813 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLIT2O94813 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLIT2O94813 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLIT2O94813 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLIT2O94813 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLIT2O94813 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLIT2O94813 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLIT2O94813 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SLIT2O94813 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SLIT2O94813 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SLIT2O94813 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SLIT2O94813 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SLIT2O94813 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms