Protein–RNA interactions for Protein: O75379

VAMP4, Vesicle-associated membrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP4O75379 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VAMP4O75379 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
VAMP4O75379 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VAMP4O75379 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
VAMP4O75379 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VAMP4O75379 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VAMP4O75379 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VAMP4O75379 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
VAMP4O75379 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VAMP4O75379 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VAMP4O75379 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
VAMP4O75379 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
VAMP4O75379 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
VAMP4O75379 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
VAMP4O75379 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VAMP4O75379 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
VAMP4O75379 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
VAMP4O75379 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
VAMP4O75379 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
VAMP4O75379 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VAMP4O75379 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VAMP4O75379 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
VAMP4O75379 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VAMP4O75379 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VAMP4O75379 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
VAMP4O75379 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
VAMP4O75379 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
VAMP4O75379 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VAMP4O75379 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VAMP4O75379 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VAMP4O75379 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VAMP4O75379 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VAMP4O75379 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VAMP4O75379 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VAMP4O75379 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VAMP4O75379 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VAMP4O75379 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VAMP4O75379 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VAMP4O75379 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VAMP4O75379 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VAMP4O75379 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VAMP4O75379 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VAMP4O75379 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VAMP4O75379 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VAMP4O75379 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VAMP4O75379 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VAMP4O75379 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VAMP4O75379 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VAMP4O75379 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VAMP4O75379 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VAMP4O75379 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VAMP4O75379 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VAMP4O75379 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VAMP4O75379 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VAMP4O75379 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VAMP4O75379 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VAMP4O75379 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VAMP4O75379 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VAMP4O75379 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VAMP4O75379 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VAMP4O75379 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VAMP4O75379 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VAMP4O75379 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VAMP4O75379 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VAMP4O75379 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
VAMP4O75379 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VAMP4O75379 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VAMP4O75379 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VAMP4O75379 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
VAMP4O75379 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
VAMP4O75379 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
VAMP4O75379 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VAMP4O75379 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VAMP4O75379 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
VAMP4O75379 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VAMP4O75379 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VAMP4O75379 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VAMP4O75379 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VAMP4O75379 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VAMP4O75379 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VAMP4O75379 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VAMP4O75379 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VAMP4O75379 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VAMP4O75379 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VAMP4O75379 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VAMP4O75379 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VAMP4O75379 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VAMP4O75379 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VAMP4O75379 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VAMP4O75379 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VAMP4O75379 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VAMP4O75379 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VAMP4O75379 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
VAMP4O75379 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VAMP4O75379 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VAMP4O75379 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VAMP4O75379 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VAMP4O75379 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VAMP4O75379 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VAMP4O75379 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms