Protein–RNA interactions for Protein: O60271

SPAG9, C-Jun-amino-terminal kinase-interacting protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPAG9O60271 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SPAG9O60271 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SPAG9O60271 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SPAG9O60271 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SPAG9O60271 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SPAG9O60271 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SPAG9O60271 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SPAG9O60271 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SPAG9O60271 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SPAG9O60271 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SPAG9O60271 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SPAG9O60271 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SPAG9O60271 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
SPAG9O60271 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SPAG9O60271 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
SPAG9O60271 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SPAG9O60271 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
SPAG9O60271 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SPAG9O60271 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SPAG9O60271 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SPAG9O60271 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SPAG9O60271 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SPAG9O60271 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SPAG9O60271 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
SPAG9O60271 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SPAG9O60271 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SPAG9O60271 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SPAG9O60271 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SPAG9O60271 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SPAG9O60271 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SPAG9O60271 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SPAG9O60271 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SPAG9O60271 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SPAG9O60271 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SPAG9O60271 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SPAG9O60271 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SPAG9O60271 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SPAG9O60271 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SPAG9O60271 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SPAG9O60271 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SPAG9O60271 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SPAG9O60271 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SPAG9O60271 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SPAG9O60271 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SPAG9O60271 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SPAG9O60271 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SPAG9O60271 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SPAG9O60271 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SPAG9O60271 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SPAG9O60271 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SPAG9O60271 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SPAG9O60271 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SPAG9O60271 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SPAG9O60271 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SPAG9O60271 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SPAG9O60271 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
SPAG9O60271 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SPAG9O60271 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SPAG9O60271 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SPAG9O60271 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
SPAG9O60271 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
SPAG9O60271 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
SPAG9O60271 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SPAG9O60271 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SPAG9O60271 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SPAG9O60271 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SPAG9O60271 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SPAG9O60271 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SPAG9O60271 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SPAG9O60271 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SPAG9O60271 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SPAG9O60271 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SPAG9O60271 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SPAG9O60271 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SPAG9O60271 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SPAG9O60271 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SPAG9O60271 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SPAG9O60271 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SPAG9O60271 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SPAG9O60271 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SPAG9O60271 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SPAG9O60271 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SPAG9O60271 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
SPAG9O60271 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SPAG9O60271 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SPAG9O60271 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SPAG9O60271 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SPAG9O60271 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SPAG9O60271 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SPAG9O60271 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SPAG9O60271 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SPAG9O60271 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SPAG9O60271 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SPAG9O60271 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SPAG9O60271 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SPAG9O60271 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SPAG9O60271 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SPAG9O60271 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SPAG9O60271 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
SPAG9O60271 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms