Protein–RNA interactions for Protein: O43242

PSMD3, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD3O43242 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PSMD3O43242 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PSMD3O43242 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PSMD3O43242 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PSMD3O43242 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PSMD3O43242 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PSMD3O43242 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PSMD3O43242 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PSMD3O43242 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PSMD3O43242 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PSMD3O43242 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PSMD3O43242 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PSMD3O43242 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PSMD3O43242 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PSMD3O43242 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PSMD3O43242 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PSMD3O43242 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PSMD3O43242 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PSMD3O43242 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PSMD3O43242 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PSMD3O43242 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PSMD3O43242 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PSMD3O43242 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PSMD3O43242 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PSMD3O43242 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
PSMD3O43242 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PSMD3O43242 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PSMD3O43242 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PSMD3O43242 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
PSMD3O43242 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PSMD3O43242 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PSMD3O43242 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
PSMD3O43242 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PSMD3O43242 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PSMD3O43242 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PSMD3O43242 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
PSMD3O43242 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PSMD3O43242 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PSMD3O43242 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
PSMD3O43242 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PSMD3O43242 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PSMD3O43242 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PSMD3O43242 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PSMD3O43242 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PSMD3O43242 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
PSMD3O43242 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
PSMD3O43242 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
PSMD3O43242 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
PSMD3O43242 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
PSMD3O43242 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PSMD3O43242 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PSMD3O43242 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PSMD3O43242 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PSMD3O43242 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PSMD3O43242 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PSMD3O43242 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PSMD3O43242 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PSMD3O43242 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PSMD3O43242 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PSMD3O43242 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PSMD3O43242 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PSMD3O43242 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PSMD3O43242 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PSMD3O43242 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PSMD3O43242 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PSMD3O43242 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PSMD3O43242 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PSMD3O43242 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PSMD3O43242 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PSMD3O43242 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PSMD3O43242 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PSMD3O43242 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PSMD3O43242 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PSMD3O43242 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PSMD3O43242 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PSMD3O43242 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PSMD3O43242 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PSMD3O43242 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PSMD3O43242 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PSMD3O43242 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PSMD3O43242 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PSMD3O43242 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PSMD3O43242 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PSMD3O43242 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PSMD3O43242 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PSMD3O43242 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PSMD3O43242 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PSMD3O43242 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PSMD3O43242 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PSMD3O43242 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PSMD3O43242 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PSMD3O43242 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PSMD3O43242 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PSMD3O43242 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PSMD3O43242 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PSMD3O43242 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PSMD3O43242 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PSMD3O43242 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PSMD3O43242 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PSMD3O43242 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms