Protein–RNA interactions for Protein: O43147

SGSM2, Small G protein signaling modulator 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,006 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM2O43147 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SGSM2O43147 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SGSM2O43147 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SGSM2O43147 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SGSM2O43147 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SGSM2O43147 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SGSM2O43147 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SGSM2O43147 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SGSM2O43147 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SGSM2O43147 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SGSM2O43147 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SGSM2O43147 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SGSM2O43147 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SGSM2O43147 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SGSM2O43147 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SGSM2O43147 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SGSM2O43147 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SGSM2O43147 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SGSM2O43147 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SGSM2O43147 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SGSM2O43147 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SGSM2O43147 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SGSM2O43147 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SGSM2O43147 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SGSM2O43147 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SGSM2O43147 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SGSM2O43147 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SGSM2O43147 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SGSM2O43147 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SGSM2O43147 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SGSM2O43147 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SGSM2O43147 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SGSM2O43147 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SGSM2O43147 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SGSM2O43147 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SGSM2O43147 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SGSM2O43147 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SGSM2O43147 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SGSM2O43147 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SGSM2O43147 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SGSM2O43147 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SGSM2O43147 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SGSM2O43147 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SGSM2O43147 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SGSM2O43147 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SGSM2O43147 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SGSM2O43147 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SGSM2O43147 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SGSM2O43147 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SGSM2O43147 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SGSM2O43147 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SGSM2O43147 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SGSM2O43147 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SGSM2O43147 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SGSM2O43147 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SGSM2O43147 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SGSM2O43147 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SGSM2O43147 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SGSM2O43147 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SGSM2O43147 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SGSM2O43147 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SGSM2O43147 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SGSM2O43147 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SGSM2O43147 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SGSM2O43147 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SGSM2O43147 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SGSM2O43147 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SGSM2O43147 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SGSM2O43147 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
SGSM2O43147 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
SGSM2O43147 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SGSM2O43147 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SGSM2O43147 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SGSM2O43147 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SGSM2O43147 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SGSM2O43147 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SGSM2O43147 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SGSM2O43147 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SGSM2O43147 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SGSM2O43147 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SGSM2O43147 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SGSM2O43147 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SGSM2O43147 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SGSM2O43147 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SGSM2O43147 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SGSM2O43147 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SGSM2O43147 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SGSM2O43147 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SGSM2O43147 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SGSM2O43147 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SGSM2O43147 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SGSM2O43147 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SGSM2O43147 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SGSM2O43147 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SGSM2O43147 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SGSM2O43147 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SGSM2O43147 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SGSM2O43147 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SGSM2O43147 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SGSM2O43147 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms