Protein–RNA interactions for Protein: O15084

ANKRD28, Serine/threonine-protein phosphatase 6 regulatory ankyrin repeat subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28O15084 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ANKRD28O15084 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ANKRD28O15084 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ANKRD28O15084 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ANKRD28O15084 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ANKRD28O15084 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ANKRD28O15084 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ANKRD28O15084 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ANKRD28O15084 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ANKRD28O15084 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ANKRD28O15084 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ANKRD28O15084 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ANKRD28O15084 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
ANKRD28O15084 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ANKRD28O15084 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ANKRD28O15084 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ANKRD28O15084 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
ANKRD28O15084 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ANKRD28O15084 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ANKRD28O15084 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ANKRD28O15084 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ANKRD28O15084 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ANKRD28O15084 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ANKRD28O15084 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ANKRD28O15084 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ANKRD28O15084 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ANKRD28O15084 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ANKRD28O15084 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ANKRD28O15084 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ANKRD28O15084 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ANKRD28O15084 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ANKRD28O15084 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
ANKRD28O15084 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ANKRD28O15084 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ANKRD28O15084 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ANKRD28O15084 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ANKRD28O15084 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ANKRD28O15084 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ANKRD28O15084 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ANKRD28O15084 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ANKRD28O15084 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ANKRD28O15084 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ANKRD28O15084 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ANKRD28O15084 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ANKRD28O15084 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ANKRD28O15084 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ANKRD28O15084 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ANKRD28O15084 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ANKRD28O15084 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ANKRD28O15084 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ANKRD28O15084 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ANKRD28O15084 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ANKRD28O15084 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
ANKRD28O15084 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
ANKRD28O15084 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
ANKRD28O15084 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
ANKRD28O15084 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
ANKRD28O15084 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ANKRD28O15084 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ANKRD28O15084 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ANKRD28O15084 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
ANKRD28O15084 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ANKRD28O15084 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ANKRD28O15084 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ANKRD28O15084 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ANKRD28O15084 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ANKRD28O15084 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ANKRD28O15084 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ANKRD28O15084 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ANKRD28O15084 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ANKRD28O15084 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ANKRD28O15084 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ANKRD28O15084 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ANKRD28O15084 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ANKRD28O15084 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ANKRD28O15084 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ANKRD28O15084 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ANKRD28O15084 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ANKRD28O15084 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ANKRD28O15084 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ANKRD28O15084 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ANKRD28O15084 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ANKRD28O15084 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ANKRD28O15084 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ANKRD28O15084 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ANKRD28O15084 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ANKRD28O15084 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ANKRD28O15084 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
ANKRD28O15084 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ANKRD28O15084 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ANKRD28O15084 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ANKRD28O15084 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ANKRD28O15084 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ANKRD28O15084 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ANKRD28O15084 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ANKRD28O15084 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ANKRD28O15084 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ANKRD28O15084 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ANKRD28O15084 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ANKRD28O15084 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms