Protein–RNA interactions for Protein: O15061

SYNM, Synemin, humanhuman

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNMO15061 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SYNMO15061 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SYNMO15061 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SYNMO15061 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SYNMO15061 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SYNMO15061 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SYNMO15061 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SYNMO15061 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SYNMO15061 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SYNMO15061 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SYNMO15061 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SYNMO15061 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SYNMO15061 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SYNMO15061 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SYNMO15061 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SYNMO15061 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SYNMO15061 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SYNMO15061 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SYNMO15061 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SYNMO15061 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SYNMO15061 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SYNMO15061 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SYNMO15061 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SYNMO15061 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SYNMO15061 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SYNMO15061 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SYNMO15061 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SYNMO15061 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SYNMO15061 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SYNMO15061 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SYNMO15061 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SYNMO15061 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SYNMO15061 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SYNMO15061 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SYNMO15061 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SYNMO15061 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SYNMO15061 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SYNMO15061 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SYNMO15061 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SYNMO15061 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SYNMO15061 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SYNMO15061 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SYNMO15061 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SYNMO15061 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SYNMO15061 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SYNMO15061 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SYNMO15061 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SYNMO15061 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SYNMO15061 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SYNMO15061 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SYNMO15061 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SYNMO15061 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SYNMO15061 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SYNMO15061 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SYNMO15061 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SYNMO15061 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SYNMO15061 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SYNMO15061 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SYNMO15061 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SYNMO15061 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SYNMO15061 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SYNMO15061 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SYNMO15061 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SYNMO15061 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SYNMO15061 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SYNMO15061 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SYNMO15061 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SYNMO15061 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SYNMO15061 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SYNMO15061 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SYNMO15061 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SYNMO15061 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SYNMO15061 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SYNMO15061 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
SYNMO15061 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
SYNMO15061 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SYNMO15061 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SYNMO15061 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
SYNMO15061 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SYNMO15061 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SYNMO15061 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SYNMO15061 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SYNMO15061 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SYNMO15061 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
SYNMO15061 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SYNMO15061 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SYNMO15061 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SYNMO15061 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SYNMO15061 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SYNMO15061 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SYNMO15061 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SYNMO15061 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SYNMO15061 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SYNMO15061 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SYNMO15061 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SYNMO15061 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SYNMO15061 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
SYNMO15061 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SYNMO15061 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SYNMO15061 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms