Protein–RNA interactions for Protein: J3KSC0

LINC01387, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01387, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01387J3KSC0 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC01387J3KSC0 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC01387J3KSC0 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC01387J3KSC0 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC01387J3KSC0 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC01387J3KSC0 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC01387J3KSC0 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC01387J3KSC0 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC01387J3KSC0 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC01387J3KSC0 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC01387J3KSC0 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC01387J3KSC0 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC01387J3KSC0 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC01387J3KSC0 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC01387J3KSC0 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC01387J3KSC0 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC01387J3KSC0 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC01387J3KSC0 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC01387J3KSC0 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC01387J3KSC0 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC01387J3KSC0 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC01387J3KSC0 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC01387J3KSC0 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC01387J3KSC0 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC01387J3KSC0 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC01387J3KSC0 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC01387J3KSC0 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC01387J3KSC0 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC01387J3KSC0 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC01387J3KSC0 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC01387J3KSC0 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC01387J3KSC0 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC01387J3KSC0 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC01387J3KSC0 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC01387J3KSC0 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC01387J3KSC0 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC01387J3KSC0 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC01387J3KSC0 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC01387J3KSC0 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC01387J3KSC0 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC01387J3KSC0 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC01387J3KSC0 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC01387J3KSC0 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC01387J3KSC0 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC01387J3KSC0 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC01387J3KSC0 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC01387J3KSC0 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC01387J3KSC0 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC01387J3KSC0 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC01387J3KSC0 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC01387J3KSC0 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC01387J3KSC0 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC01387J3KSC0 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC01387J3KSC0 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC01387J3KSC0 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC01387J3KSC0 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC01387J3KSC0 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC01387J3KSC0 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC01387J3KSC0 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC01387J3KSC0 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC01387J3KSC0 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC01387J3KSC0 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC01387J3KSC0 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC01387J3KSC0 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC01387J3KSC0 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC01387J3KSC0 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC01387J3KSC0 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC01387J3KSC0 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC01387J3KSC0 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC01387J3KSC0 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC01387J3KSC0 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC01387J3KSC0 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC01387J3KSC0 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC01387J3KSC0 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC01387J3KSC0 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC01387J3KSC0 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC01387J3KSC0 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC01387J3KSC0 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC01387J3KSC0 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC01387J3KSC0 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC01387J3KSC0 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC01387J3KSC0 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC01387J3KSC0 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC01387J3KSC0 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC01387J3KSC0 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC01387J3KSC0 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC01387J3KSC0 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC01387J3KSC0 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC01387J3KSC0 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC01387J3KSC0 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC01387J3KSC0 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC01387J3KSC0 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC01387J3KSC0 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC01387J3KSC0 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC01387J3KSC0 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC01387J3KSC0 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC01387J3KSC0 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC01387J3KSC0 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC01387J3KSC0 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC01387J3KSC0 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms