Protein–RNA interactions for Protein: C9JE40

PATL2, Protein PAT1 homolog 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATL2C9JE40 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PATL2C9JE40 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PATL2C9JE40 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PATL2C9JE40 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PATL2C9JE40 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PATL2C9JE40 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PATL2C9JE40 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PATL2C9JE40 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PATL2C9JE40 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PATL2C9JE40 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PATL2C9JE40 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PATL2C9JE40 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PATL2C9JE40 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PATL2C9JE40 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PATL2C9JE40 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PATL2C9JE40 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PATL2C9JE40 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PATL2C9JE40 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PATL2C9JE40 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PATL2C9JE40 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PATL2C9JE40 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PATL2C9JE40 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PATL2C9JE40 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PATL2C9JE40 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PATL2C9JE40 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PATL2C9JE40 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PATL2C9JE40 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PATL2C9JE40 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PATL2C9JE40 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PATL2C9JE40 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PATL2C9JE40 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PATL2C9JE40 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PATL2C9JE40 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PATL2C9JE40 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PATL2C9JE40 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PATL2C9JE40 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PATL2C9JE40 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PATL2C9JE40 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PATL2C9JE40 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PATL2C9JE40 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PATL2C9JE40 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PATL2C9JE40 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PATL2C9JE40 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PATL2C9JE40 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PATL2C9JE40 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PATL2C9JE40 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PATL2C9JE40 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PATL2C9JE40 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PATL2C9JE40 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PATL2C9JE40 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PATL2C9JE40 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PATL2C9JE40 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PATL2C9JE40 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PATL2C9JE40 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PATL2C9JE40 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PATL2C9JE40 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PATL2C9JE40 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PATL2C9JE40 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PATL2C9JE40 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PATL2C9JE40 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PATL2C9JE40 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PATL2C9JE40 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PATL2C9JE40 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PATL2C9JE40 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
PATL2C9JE40 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PATL2C9JE40 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PATL2C9JE40 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PATL2C9JE40 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PATL2C9JE40 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PATL2C9JE40 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PATL2C9JE40 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PATL2C9JE40 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PATL2C9JE40 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PATL2C9JE40 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
PATL2C9JE40 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PATL2C9JE40 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PATL2C9JE40 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PATL2C9JE40 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PATL2C9JE40 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PATL2C9JE40 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PATL2C9JE40 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PATL2C9JE40 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PATL2C9JE40 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PATL2C9JE40 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PATL2C9JE40 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PATL2C9JE40 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PATL2C9JE40 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
PATL2C9JE40 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PATL2C9JE40 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PATL2C9JE40 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PATL2C9JE40 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PATL2C9JE40 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PATL2C9JE40 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
PATL2C9JE40 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PATL2C9JE40 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PATL2C9JE40 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PATL2C9JE40 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PATL2C9JE40 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PATL2C9JE40 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PATL2C9JE40 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms