Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPZ6

THSD7A, Thrombospondin type-1 domain-containing protein 7A, humanhuman

Predictions only

Length 1,657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THSD7AQ9UPZ6 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
THSD7AQ9UPZ6 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
THSD7AQ9UPZ6 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
THSD7AQ9UPZ6 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
THSD7AQ9UPZ6 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
THSD7AQ9UPZ6 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
THSD7AQ9UPZ6 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
THSD7AQ9UPZ6 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
THSD7AQ9UPZ6 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
THSD7AQ9UPZ6 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
THSD7AQ9UPZ6 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
THSD7AQ9UPZ6 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
THSD7AQ9UPZ6 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
THSD7AQ9UPZ6 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
THSD7AQ9UPZ6 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
THSD7AQ9UPZ6 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
THSD7AQ9UPZ6 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
THSD7AQ9UPZ6 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
THSD7AQ9UPZ6 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
THSD7AQ9UPZ6 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
THSD7AQ9UPZ6 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
THSD7AQ9UPZ6 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
THSD7AQ9UPZ6 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
THSD7AQ9UPZ6 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
THSD7AQ9UPZ6 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
THSD7AQ9UPZ6 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
THSD7AQ9UPZ6 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
THSD7AQ9UPZ6 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
THSD7AQ9UPZ6 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
THSD7AQ9UPZ6 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
THSD7AQ9UPZ6 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
THSD7AQ9UPZ6 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
THSD7AQ9UPZ6 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
THSD7AQ9UPZ6 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
THSD7AQ9UPZ6 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
THSD7AQ9UPZ6 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
THSD7AQ9UPZ6 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
THSD7AQ9UPZ6 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
THSD7AQ9UPZ6 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
THSD7AQ9UPZ6 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
THSD7AQ9UPZ6 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
THSD7AQ9UPZ6 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
THSD7AQ9UPZ6 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
THSD7AQ9UPZ6 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
THSD7AQ9UPZ6 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
THSD7AQ9UPZ6 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
THSD7AQ9UPZ6 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
THSD7AQ9UPZ6 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
THSD7AQ9UPZ6 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
THSD7AQ9UPZ6 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
THSD7AQ9UPZ6 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
THSD7AQ9UPZ6 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
THSD7AQ9UPZ6 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
THSD7AQ9UPZ6 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
THSD7AQ9UPZ6 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
THSD7AQ9UPZ6 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
THSD7AQ9UPZ6 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
THSD7AQ9UPZ6 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
THSD7AQ9UPZ6 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
THSD7AQ9UPZ6 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
THSD7AQ9UPZ6 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
THSD7AQ9UPZ6 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
THSD7AQ9UPZ6 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
THSD7AQ9UPZ6 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
THSD7AQ9UPZ6 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
THSD7AQ9UPZ6 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
THSD7AQ9UPZ6 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
THSD7AQ9UPZ6 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
THSD7AQ9UPZ6 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
THSD7AQ9UPZ6 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
THSD7AQ9UPZ6 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
THSD7AQ9UPZ6 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
THSD7AQ9UPZ6 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
THSD7AQ9UPZ6 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
THSD7AQ9UPZ6 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
THSD7AQ9UPZ6 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
THSD7AQ9UPZ6 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
THSD7AQ9UPZ6 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
THSD7AQ9UPZ6 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
THSD7AQ9UPZ6 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
THSD7AQ9UPZ6 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
THSD7AQ9UPZ6 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
THSD7AQ9UPZ6 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
THSD7AQ9UPZ6 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
THSD7AQ9UPZ6 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
THSD7AQ9UPZ6 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
THSD7AQ9UPZ6 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
THSD7AQ9UPZ6 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
THSD7AQ9UPZ6 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
THSD7AQ9UPZ6 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
THSD7AQ9UPZ6 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
THSD7AQ9UPZ6 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
THSD7AQ9UPZ6 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
THSD7AQ9UPZ6 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
THSD7AQ9UPZ6 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
THSD7AQ9UPZ6 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
THSD7AQ9UPZ6 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
THSD7AQ9UPZ6 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
THSD7AQ9UPZ6 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
THSD7AQ9UPZ6 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms