Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX8

SHANK2, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK2Q9UPX8 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SHANK2Q9UPX8 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SHANK2Q9UPX8 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SHANK2Q9UPX8 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SHANK2Q9UPX8 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SHANK2Q9UPX8 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SHANK2Q9UPX8 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC26.08■■□□□ 1.76
SHANK2Q9UPX8 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
SHANK2Q9UPX8 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SHANK2Q9UPX8 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SHANK2Q9UPX8 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SHANK2Q9UPX8 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SHANK2Q9UPX8 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SHANK2Q9UPX8 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
SHANK2Q9UPX8 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SHANK2Q9UPX8 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SHANK2Q9UPX8 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SHANK2Q9UPX8 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
SHANK2Q9UPX8 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
SHANK2Q9UPX8 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SHANK2Q9UPX8 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SHANK2Q9UPX8 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SHANK2Q9UPX8 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
SHANK2Q9UPX8 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SHANK2Q9UPX8 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SHANK2Q9UPX8 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SHANK2Q9UPX8 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SHANK2Q9UPX8 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SHANK2Q9UPX8 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SHANK2Q9UPX8 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SHANK2Q9UPX8 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SHANK2Q9UPX8 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
SHANK2Q9UPX8 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SHANK2Q9UPX8 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SHANK2Q9UPX8 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SHANK2Q9UPX8 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
SHANK2Q9UPX8 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SHANK2Q9UPX8 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SHANK2Q9UPX8 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SHANK2Q9UPX8 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SHANK2Q9UPX8 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SHANK2Q9UPX8 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SHANK2Q9UPX8 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SHANK2Q9UPX8 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SHANK2Q9UPX8 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SHANK2Q9UPX8 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SHANK2Q9UPX8 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SHANK2Q9UPX8 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SHANK2Q9UPX8 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SHANK2Q9UPX8 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SHANK2Q9UPX8 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SHANK2Q9UPX8 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SHANK2Q9UPX8 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SHANK2Q9UPX8 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SHANK2Q9UPX8 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SHANK2Q9UPX8 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SHANK2Q9UPX8 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SHANK2Q9UPX8 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SHANK2Q9UPX8 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SHANK2Q9UPX8 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
SHANK2Q9UPX8 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SHANK2Q9UPX8 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SHANK2Q9UPX8 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SHANK2Q9UPX8 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SHANK2Q9UPX8 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SHANK2Q9UPX8 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SHANK2Q9UPX8 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SHANK2Q9UPX8 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SHANK2Q9UPX8 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SHANK2Q9UPX8 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SHANK2Q9UPX8 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SHANK2Q9UPX8 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SHANK2Q9UPX8 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SHANK2Q9UPX8 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SHANK2Q9UPX8 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
SHANK2Q9UPX8 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SHANK2Q9UPX8 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SHANK2Q9UPX8 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SHANK2Q9UPX8 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
SHANK2Q9UPX8 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SHANK2Q9UPX8 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SHANK2Q9UPX8 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SHANK2Q9UPX8 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SHANK2Q9UPX8 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SHANK2Q9UPX8 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SHANK2Q9UPX8 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SHANK2Q9UPX8 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SHANK2Q9UPX8 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SHANK2Q9UPX8 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SHANK2Q9UPX8 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SHANK2Q9UPX8 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SHANK2Q9UPX8 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SHANK2Q9UPX8 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SHANK2Q9UPX8 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SHANK2Q9UPX8 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SHANK2Q9UPX8 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SHANK2Q9UPX8 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SHANK2Q9UPX8 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SHANK2Q9UPX8 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
SHANK2Q9UPX8 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms